SRSF9

SRSF9
Ідентифікатори
Символи	SRSF9, SFRS9, SRp30c, serine/arginine-rich splicing factor 9, serine and arginine rich splicing factor 9
Зовнішні ІД	OMIM: 601943 MGI: 104896 HomoloGene: 20819 GeneCards: SRSF9
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • protein domain specific binding Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • mRNA splice site selection • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • response to alkaloid • RNA export from nucleus • Сплайсинг РНК • response to toxic substance • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA cis splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8683	108014
Ensembl	ENSG00000111786	ENSMUSG00000029538
UniProt	Q13242	Q9D0B0
RefSeq (мРНК)	NM_003769	NM_025573
RefSeq (білок)	NP_003760	NP_079849
Локус (UCSC)	Хр. 12: 120.46 – 120.47 Mb	Хр. 5: 115.47 – 115.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRSF9 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 221 амінокислот, а молекулярна маса — 25 542.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGWADERGG		EGDGRIYVGN		LPTDVREKDL		EDLFYKYGRI		REIELKNRHG
LVPFAFVRFE		DPRDAEDAIY		GRNGYDYGQC		RLRVEFPRTY		GGRGGWPRGG
RNGPPTRRSD		FRVLVSGLPP		SGSWQDLKDH		MREAGDVCYA		DVQKDGVGMV
EYLRKEDMEY		ALRKLDDTKF		RSHEGETSYI		RVYPERSTSY		GYSRSRSGSR
GRDSPYQSRG		SPHYFSPFRP		Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yuan Y., Li D.-M., Sun H. (1998). PIR1, a novel phosphatase that exhibits high affinity to RNA ribonucleoprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 20347—20353. PMID 9685386 DOI:10.1074/jbc.273.32.20347
• Stoss O., Schwaiger F.-W., Cooper T.A., Stamm S. (1999). Alternative splicing determines the intracellular localization of the novel nuclear protein Nop30 and its interaction with the splicing factor SRp30c. J. Biol. Chem. 274: 10951—10962. PMID 10196175 DOI:10.1074/jbc.274.16.10951
• Simard M.J., Chabot B. (2002). SRp30c is a repressor of 3' splice site utilization. Mol. Cell. Biol. 22: 4001—4010. PMID 12024014 DOI:10.1128/MCB.22.12.4001-4010.2002
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Див. також

• Хромосома 12