SSBP3

SSBP3
Ідентифікатори
Символи	SSBP3, CSDP, SSDP, SSDP1, single stranded DNA binding protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 607390 MGI: 1919725 HomoloGene: 23411 GeneCards: SSBP3
Онтологія гена Молекулярна функція • single-stranded DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • midbrain-hindbrain boundary initiation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • prechordal plate formation • head morphogenesis • positive regulation of anterior head development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • hematopoietic progenitor cell differentiation • transcription, DNA-templated • positive regulation of cell population proliferation • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • head development • GO:0034622 protein-containing complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23648	72475
Ensembl	ENSG00000157216	ENSMUSG00000061887
UniProt	Q9BWW4	Q9D032
RefSeq (мРНК)	NM_001009955 NM_018070 NM_145716	NM_023672 NM_198438 NM_001355532
RefSeq (білок)	NP_001009955 NP_060540 NP_663768	NP_076161 NP_940840 NP_001342461
Локус (UCSC)	Хр. 1: 54.23 – 54.41 Mb	Хр. 4: 106.77 – 106.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SSBP3 (англ. Single stranded DNA binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 388 амінокислот, а молекулярна маса — 40 421.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFAKGKGSAV		PSDGQAREKL		ALYVYEYLLH		VGAQKSAQTF		LSEIRWEKNI
TLGEPPGFLH		SWWCVFWDLY		CAAPERRDTC		EHSSEAKAFH		DYSAAAAPSP
VLGNIPPNDG		MPGGPIPPGF		FQGPPGSQPS		PHAQPPPHNP		SSMMGPHSQP
FMSPRYAGGP		RPPIRMGNQP		PGGVPGTQPL		LPNSMDPTRQ		QGHPNMGGSM
QRMNPPRGMG		PMGPGPQNYG		SGMRPPPNSL		GPAMPGINMG		PGAGRPWPNP
NSANSIPYSS		SSPGTYVGPP		GGGGPPGTPI		MPSPADSTNS		SDNIYTMINP
VPPGGSRSNF		PMGPGSDGPM		GGMGGMEPHH		MNGSLGSGDI		DGLPKNSPNN
ISGISNPPGT		PRDDGELGGN		FLHSFQNDNY		SPSMTMSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Castro P.D., Liang H., Liang J.C., Nagarajan L. (2002). A novel, evolutionarily conserved gene family with putative sequence-specific single-stranded DNA-binding activity. Genomics. 80: 78—85. PMID 12079286 DOI:10.1006/geno.2002.6805
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1