SSX2

SSX2B
Ідентифікатори
Символи	SSX2B, CT5.2, CT5.2b, HOM-MEL-40, SSX, synovial sarcoma, X breakpoint 2B, SSX family member 2B
Зовнішні ІД	HomoloGene: 133226 GeneCards: SSX2B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • nucleic acid binding Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро Біологічний процес • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	727837	н/д
Ensembl	ENSG00000268447	н/д
UniProt	Q16385	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001278702 NM_001164417 NM_001278701	н/д
RefSeq (білок)	NP_001157889 NP_001265630 NP_001265631	н/д
Локус (UCSC)	Хр. X: 52.75 – 52.79 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

SSX2 (англ. SSX family member 2B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 188 амінокислот, а молекулярна маса — 21 620.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNGDDAFARR		PTVGAQIPEK		IQKAFDDIAK		YFSKEEWEKM		KASEKIFYVY
MKRKYEAMTK		LGFKATLPPF		MCNKRAEDFQ		GNDLDNDPNR		GNQVERPQMT
FGRLQGISPK		IMPKKPAEEG		NDSEEVPEAS		GPQNDGKELC		PPGKPTTSEK
IHERSGPKRG		EHAWTHRLRE		RKQLVIYEEI		SDPEEDDE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• de Leeuw B., Balemans M., Olde Weghuis D., Geurts van Kessel A. (1995). Identification of two alternative fusion genes, SYT-SSX1 and SYT-SSX2, in t(X;18)(p11.2;q11.2)-positive synovial sarcomas. Hum. Mol. Genet. 4: 1097—1099. PMID 7655467 DOI:10.1093/hmg/4.6.1097

Див. також

• Хромосома X