STRAP

STRAP
Ідентифікатори
Символи	STRAP, MAWD, PT-WD, UNRIP, serine/threonine kinase receptor associated protein
Зовнішні ІД	OMIM: 605986 MGI: 1329037 HomoloGene: 43881 GeneCards: STRAP
Онтологія гена Молекулярна функція • signaling receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • SMN complex • SMN-Sm protein complex • гіалоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • mRNA processing • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of epithelial cell migration • maintenance of gastrointestinal epithelium • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • negative regulation of epithelial to mesenchymal transition • negative regulation of pathway-restricted SMAD protein phosphorylation • Сплайсинг РНК • negative regulation of epithelial cell proliferation • spliceosomal snRNP assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11171	20901
Ensembl	ENSG00000023734	ENSMUSG00000030224
UniProt	Q9Y3F4	Q9Z1Z2
RefSeq (мРНК)	NM_007178	NM_011499
RefSeq (білок)	NP_009109	NP_035629
Локус (UCSC)	Хр. 12: 15.88 – 15.9 Mb	Хр. 6: 137.71 – 137.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

STRAP (англ. Serine/threonine kinase receptor associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 350 амінокислот, а молекулярна маса — 38 438.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAMRQTPLTC		SGHTRPVVDL		AFSGITPYGY		FLISACKDGK		PMLRQGDTGD
WIGTFLGHKG		AVWGATLNKD		ATKAATAAAD		FTAKVWDAVS		GDELMTLAHK
HIVKTVDFTQ		DSNYLLTGGQ		DKLLRIYDLN		KPEAEPKEIS		GHTSGIKKAL
WCSEDKQILS		ADDKTVRLWD		HATMTEVKSL		NFNMSVSSME		YIPEGEILVI
TYGRSIAFHS		AVSLDPIKSF		EAPATINSAS		LHPEKEFLVA		GGEDFKLYKY
DYNSGEELES		YKGHFGPIHC		VRFSPDGELY		ASGSEDGTLR		LWQTVVGKTY
GLWKCVLPEE		DSGELAKPKI		GFPETTEEEL		EEIASENSDC		IFPSAPDVKA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Hunt S.L., Hsuan J.J., Totty N., Jackson R.J. (1999). unr, a cellular cytoplasmic RNA-binding protein with five cold-shock domains, is required for internal initiation of translation of human rhinovirus RNA. Genes Dev. 13: 437—448. PMID 10049359 DOI:10.1101/gad.13.4.437
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Seong H.A., Jung H., Choi H.S., Kim K.T., Ha H. (2005). Regulation of transforming growth factor-beta signaling and PDK1 kinase activity by physical interaction between PDK1 and serine-threonine kinase receptor-associated protein. J. Biol. Chem. 280: 42897—42908. PMID 16251192 DOI:10.1074/jbc.M507539200

Див. також

• Хромосома 12