STRBP

STRBP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DMY
Ідентифікатори
Символи	STRBP, HEL162, ILF3L, SPNR, p74, spermatid perinuclear RNA binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 611138 MGI: 104626 HomoloGene: 7548 GeneCards: STRBP
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • double-stranded RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • RNA binding • microtubule binding • tubulin binding Клітинна компонента • цитоплазма • microtubule cytoskeleton • клітинне ядро • manchette Біологічний процес • multicellular organism development • mechanosensory behavior • диференціація клітин • Сперматогенез • spermatid development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55342	20744
Ensembl	ENSG00000165209	ENSMUSG00000026915
UniProt	Q96SI9	Q91WM1
RefSeq (мРНК)	NM_001171137 NM_018387 NM_001376106 NM_001376107 NM_001376109	NM_009261 NM_176932 NM_001355259 NM_001379314 NM_001379315 NM_001379316
RefSeq (білок)	NP_001164608 NP_060857 NP_001363035 NP_001363036 NP_001363038	NP_033287 NP_001342188 NP_001366243 NP_001366244 NP_001366245
Локус (UCSC)	Хр. 9: 123.11 – 123.27 Mb	Хр. 2: 37.37 – 37.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

STRBP (англ. Spermatid perinuclear RNA binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 672 амінокислот, а молекулярна маса — 73 653.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRSIRSFAND		DRHVMVKHST		IYPSPEELEA		VQNMVSTVEC		ALKHVSDWLD
ETNKGTKTEG		ETEVKKDEAG		ENYSKDQGGR		TLCGVMRIGL		VAKGLLIKDD
MDLELVLMCK		DKPTETLLNT		VKDNLPIQIQ		KLTEEKYQVE		QCVNEASIII
RNTKEPTLTL		KVILTSPLIR		DELEKKDGEN		VSMKDPPDLL		DRQKCLNALA
SLRHAKWFQA		RANGLKSCVI		VLRILRDLCN		RVPTWAPLKG		WPLELICEKS
IGTCNRPLGA		GEALRRVMEC		LASGILLPGG		PGLHDPCERD		PTDALSYMTI
QQKEDITHSA		QHALRLSAFG		QIYKVLEMDP		LPSSKPFQKY		SWSVTDKEGA
GSSALKRPFE		DGLGDDKDPN		KKMKRNLRKI		LDSKAIDLMN		ALMRLNQIRP
GLQYKLLSQS		GPVHAPVFTM		SVDVDGTTYE		ASGPSKKTAK		LHVAVKVLQA
MGYPTGFDAD		IECMSSDEKS		DNESKNETVS		SNSSNNTGNS		TTETSSTLEV
RTQGPILTAS		GKNPVMELNE		KRRGLKYELI		SETGGSHDKR		FVMEVEVDGQ
KFRGAGPNKK		VAKASAALAA		LEKLFSGPNA		ANNKKKKIIP		QAKGVVNTAV
SAAVQAVRGR		GRGTLTRGAF		VGATAAPGYI		APGYGTPYGY		STAAPAYGLP
KRMVLLPVMK		FPTYPVPHYS		FF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9