SUDS3

SUDS3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2N2H, 4ZQA
Ідентифікатори
Символи	SUDS3, SAP45, SDS3, SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component
Зовнішні ІД	OMIM: 608250 MGI: 1919204 HomoloGene: 15906 GeneCards: SUDS3
Онтологія гена Молекулярна функція • histone deacetylase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • histone deacetylase activity Клітинна компонента • Sin3 complex • нуклеоплазма • Sin3-type complex • клітинне ядро • гіалоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • substantia nigra development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • positive regulation of apoptotic process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone deacetylation • GO:0097285 апоптоз • protein deubiquitination • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64426	71954
Ensembl	ENSG00000111707	ENSMUSG00000066900
UniProt	Q9H7L9	Q8BR65
RefSeq (мРНК)	NM_022491	NM_001122666 NM_178622
RefSeq (білок)	NP_071936	NP_001116138 NP_848737
Локус (UCSC)	Хр. 12: 118.38 – 118.42 Mb	Хр. 5: 117.23 – 117.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SUDS3 (англ. SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 328 амінокислот, а молекулярна маса — 38 136.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAAGLLAPA		PAQAGAPPAP		EYYPEEDEEL		ESAEDDERSC		RGRESDEDTE
DASETDLAKH		DEEDYVEMKE		QMYQDKLASL		KRQLQQLQEG		TLQEYQKRMK
KLDQQYKERI		RNAELFLQLE		TEQVERNYIK		EKKAAVKEFE		DKKVELKENL
IAELEEKKKM		IENEKLTMEL		TGDSMEVKPI		MTRKLRRRPN		DPVPIPDKRR
KPAPAQLNYL		LTDEQIMEDL		RTLNKLKSPK		RPASPSSPEH		LPATPAESPA
QRFEARIEDG		KLYYDKRWYH		KSQAIYLESK		DNQKLSCVIS		SVGANEIWVR
KTSDSTKMRI		YLGQLQRGLF		VIRRRSAA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

• Fleischer T.C., Yun U.J., Ayer D.E. (2003). Identification and characterization of three new components of the mSin3A corepressor complex. Mol. Cell. Biol. 23: 3456—3467. PMID 12724404 DOI:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., Eisenman R.N., Herr W. (2003). Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1. Genes Dev. 17: 896—911. PMID 12670868 DOI:10.1101/gad.252103

Див. також

• Хромосома 12