SUGP1

SUGP1
Ідентифікатори
Символи	SUGP1, F23858, RBP, SF4, SURP and G-patch domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607992 MGI: 1917866 HomoloGene: 12360 GeneCards: SUGP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57794	70616
Ensembl	ENSG00000105705	ENSMUSG00000011306
UniProt	Q8IWZ8	Q8CH02
RefSeq (мРНК)	NM_021164 NM_172231 NM_182812	NM_027481 NM_001368391
RefSeq (білок)	NP_757386	NP_081757 NP_001355320
Локус (UCSC)	Хр. 19: 19.28 – 19.32 Mb	Хр. 8: 70.5 – 70.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SUGP1 (англ. SURP and G-patch domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 645 амінокислот, а молекулярна маса — 72 471.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLKMDNRDV		AGKANRWFGV		APPKSGKMNM		NILHQEELIA		QKKREIEAKM
EQKAKQNQVA		SPQPPHPGEI		TNAHNSSCIS		NKFANDGSFL		QQFLKLQKAQ
TSTDAPTSAP		SAPPSTPTPS		AGKRSLLISR		RTGLGLASLP		GPVKSYSHAK
QLPVAHRPSV		FQSPDEDEEE		DYEQWLEIKV		SPPEGAETRK		VIEKLARFVA
EGGPELEKVA		MEDYKDNPAF		AFLHDKNSRE		FLYYRKKVAE		IRKEAQKSQA
ASQKVSPPED		EEVKNLAEKL		ARFIADGGPE		VETIALQNNR		ENQAFSFLYE
PNSQGYKYYR		QKLEEFRKAK		ASSTGSFTAP		DPGLKRKSPP		EALSGSLPPA
TTCPASSTPA		PTIIPAPAAP		GKPASAATVK		RKRKSRWGPE		EDKVELPPAE
LVQRDVDASP		SPLSVQDLKG		LGYEKGKPVG		LVGVTELSDA		QKKQLKEQQE
MQQMYDMIMQ		HKRAMQDMQL		LWEKAVQQHQ		HGYDSDEEVD		SELGTWEHQL
RRMEMDKTRE		WAEQLTKMGR		GKHFIGDFLP		PDELEKFMET		FKALKEGREP
DYSEYKEFKL		TVENIGYQML		MKMGWKEGEG		LGSEGQGIKN		PVNKGTTTVD
GAGFGIDRPA		ELSKEDDEYE		AFRKRMMLAY		RFRPNPLNNP		RRPYY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Sampson N.D., Hewitt J.E. (2003). SF4 and SFRS14, two related putative splicing factors on human chromosome 19p13.11. Gene. 305: 91—100. PMID 12594045 DOI:10.1016/S0378-1119(02)01230-1
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Rappsilber J., Ryder U., Lamond A.I., Mann M. (2002). Large-scale proteomic analysis of the human spliceosome. Genome Res. 12: 1231—1245. PMID 12176931 DOI:10.1101/gr.473902

Див. також

• Хромосома 19