SUPT4H1

SUPT4H1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3H7H
Ідентифікатори
Символи	SUPT4H1, SPT4, SPT4H, SUPT4H, Supt4a, SPT4 homolog, DSIF elongation factor subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 603555 MGI: 107416 HomoloGene: 68303 GeneCards: SUPT4H1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • RNA polymerase II complex binding • single-stranded RNA binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • DSIF complex • клітинне ядро Біологічний процес • ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter • transcription, DNA-templated • negative regulation of DNA-templated transcription, elongation • positive regulation of DNA-templated transcription, elongation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • mRNA processing • regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of viral transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6827	20922
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000020485
UniProt	P63272	P63271
RefSeq (мРНК)	NM_003168	NM_009296 NM_001355753
RefSeq (білок)	NP_003159	NP_033322 NP_001342682
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 11: 87.63 – 87.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SUPT4H1 (англ. SPT4 homolog, DSIF elongation factor subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 117 амінокислот, а молекулярна маса — 13 193.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALETVPKDL		RHLRACLLCS		LVKTIDQFEY		DGCDNCDAYL		QMKGNREMVY
DCTSSSFDGI		IAMMSPEDSW		VSKWQRVSNF		KPGVYAVSVT		GRLPQGIVRE
LKSRGVAYKS		RDTAIKT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Hartzog G.A., Basrai M.A., Ricupero-Hovasse S.L., Hieter P., Winston F. (1996). Identification and analysis of a functional human homolog of the SPT4 gene of Saccharomyces cerevisiae. Mol. Cell. Biol. 16: 2848—2856. PMID 8649394 DOI:10.1128/MCB.16.6.2848
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wada T., Takagi T., Yamaguchi Y., Watanabe D., Handa H. (1998). Evidence that P-TEFb alleviates the negative effect of DSIF on RNA polymerase II-dependent transcription in vitro. EMBO J. 17: 7395—7403. PMID 9857195 DOI:10.1093/emboj/17.24.7395
• Kim J.B., Yamaguchi Y., Wada T., Handa H., Sharp P.A. (1999). Tat-SF1 protein associates with RAP30 and human SPT5 proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 5960—5968. PMID 10454543 DOI:10.1128/MCB.19.9.5960
• Ivanov D., Kwak Y.T., Guo J., Gaynor R.B. (2000). Domains in the SPT5 protein that modulate its transcriptional regulatory properties. Mol. Cell. Biol. 20: 2970—2983. PMID 10757782 DOI:10.1128/MCB.20.9.2970-2983.2000
• Ping Y.-H., Rana T.M. (2001). DSIF and NELF interact with RNA polymerase II elongation complex and HIV-1 Tat stimulates P-TEFb-mediated phosphorylation of RNA polymerase II and DSIF during transcription elongation. J. Biol. Chem. 276: 12951—12958. PMID 11112772 DOI:10.1074/jbc.M006130200

Див. також

• Хромосома 17