SUPT5H

SUPT5H
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DO3, 2E6Z, 2E70, 3H7H, 4L1U
Ідентифікатори
Символи	SUPT5H, SPT5, SPT5H, Tat-CT1, SPT5 homolog, DSIF elongation factor subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 602102 MGI: 1202400 HomoloGene: 2384 GeneCards: SUPT5H
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • enzyme binding • chromatin binding • RNA binding • DNA binding • mRNA binding Клітинна компонента • Нуклеоплазма • DSIF complex • клітинне ядро Біологічний процес • Ремоделювання хроматину • negative regulation of mRNA polyadenylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • regulation of DNA-templated transcription, elongation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription by RNA polymerase II • response to organic substance • transcription, DNA-templated • negative regulation of DNA-templated transcription, elongation • positive regulation of DNA-templated transcription, elongation • positive regulation of macroautophagy • DNA-templated transcription, elongation • single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate • positive regulation of viral transcription • клітинний цикл • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6829	20924
Ensembl	ENSG00000196235	ENSMUSG00000003435
UniProt	O00267	O55201
RefSeq (мРНК)	NM_001111020 NM_001130824 NM_001130825 NM_003169 NM_001319990 NM_001319991	NM_013676
RefSeq (білок)	NP_001104490 NP_001124296 NP_001124297 NP_001306919 NP_001306920 NP_003160	NP_038704
Локус (UCSC)	Хр. 19: 39.44 – 39.48 Mb	Хр. 7: 28.01 – 28.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SUPT5H (англ. SPT5 homolog, DSIF elongation factor subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 087 амінокислот, а молекулярна маса — 121 000.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDSEDSNFS		EEEDSERSSD		GEEAEVDEER		RSAAGSEKEE		EPEDEEEEEE
EEEYDEEEEE		EDDDRPPKKP		RHGGFILDEA		DVDDEYEDED		QWEDGAEDIL
EKEEIEASNI		DNVVLDEDRS		GARRLQNLWR		DQREEELGEY		YMKKYAKSSV
GETVYGGSDE		LSDDITQQQL		LPGVKDPNLW		TVKCKIGEER		ATAISLMRKF
IAYQFTDTPL		QIKSVVAPEH		VKGYIYVEAY		KQTHVKQAIE		GVGNLRLGYW
NQQMVPIKEM		TDVLKVVKEV		ANLKPKSWVR		LKRGIYKDDI		AQVDYVEPSQ
NTISLKMIPR		IDYDRIKARM		SLKDWFAKRK		KFKRPPQRLF		DAEKIRSLGG
DVASDGDFLI		FEGNRYSRKG		FLFKSFAMSA		VITEGVKPTL		SELEKFEDQP
EGIDLEVVTE		STGKEREHNF		QPGDNVEVCE		GELINLQGKI		LSVDGNKITI
MPKHEDLKDM		LEFPAQELRK		YFKMGDHVKV		IAGRFEGDTG		LIVRVEENFV
ILFSDLTMHE		LKVLPRDLQL		CSETASGVDV		GGQHEWGELV		QLDPQTVGVI
VRLERETFQV		LNMYGKVVTV		RHQAVTRKKD		NRFAVALDSE		QNNIHVKDIV
KVIDGPHSGR		EGEIRHLFRS		FAFLHCKKLV		ENGGMFVCKT		RHLVLAGGSK
PRDVTNFTVG		GFAPMSPRIS		SPMHPSAGGQ		RGGFGSPGGG		SGGMSRGRGR
RDNELIGQTV		RISQGPYKGY		IGVVKDATES		TARVELHSTC		QTISVDRQRL
TTVGSRRPGG		MTSTYGRTPM		YGSQTPMYGS		GSRTPMYGSQ		TPLQDGSRTP
HYGSQTPLHD		GSRTPAQSGA		WDPNNPNTPS		RAEEEYEYAF		DDEPTPSPQA
YGGTPNPQTP		GYPDPSSPQV		NPQYNPQTPG		TPAMYNTDQF		SPYAAPSPQG
SYQPSPSPQS		YHQVAPSPAG		YQNTHSPASY		HPTPSPMAYQ		ASPSPSPVGY
SPMTPGAPSP		GGYNPHTPGS		GIEQNSSDWV		TTDIQVKVRD		TYLDTQVVGQ
TGVIRSVTGG		MCSVYLKDSE		KVVSISSEHL		EPITPTKNNK		VKVILGEDRE
ATGVLLSIDG		EDGIVRMDLD		EQLKILNLRF		LGKLLEA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Stachora A.A., Schaefer R.E., Pohlmeier M., Maier G., Ponstingl H. (1997). Human Supt5h protein, a putative modulator of chromatin structure, is reversibly phosphorylated in mitosis. FEBS Lett. 409: 74—78. PMID 9199507 DOI:10.1016/S0014-5793(97)00486-9
• Wu-Baer F., Lane W.S., Gaynor R.B. (1998). Role of the human homolog of the yeast transcription factor SPT5 in HIV-1 Tat-activation. J. Mol. Biol. 277: 179—197. PMID 9514752 DOI:10.1006/jmbi.1997.1601
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wada T., Takagi T., Yamaguchi Y., Watanabe D., Handa H. (1998). Evidence that P-TEFb alleviates the negative effect of DSIF on RNA polymerase II-dependent transcription in vitro. EMBO J. 17: 7395—7403. PMID 9857195 DOI:10.1093/emboj/17.24.7395
• Parada C.A., Roeder R.G. (1999). A novel RNA polymerase II-containing complex potentiates Tat-enhanced HIV-1 transcription. EMBO J. 18: 3688—3701. PMID 10393184 DOI:10.1093/emboj/18.13.3688
• Wen Y., Shatkin A.J. (1999). Transcription elongation factor hSPT5 stimulates mRNA capping. Genes Dev. 13: 1774—1779. PMID 10421630 DOI:10.1101/gad.13.14.1774

Див. також

• Хромосома 19