SUZ12

SUZ12
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5IJ7, 5IJ8, 5HYN
Ідентифікатори
Символи	SUZ12, CHET9, JJAZ1, SUZ12 polycomb repressive complex 2 subunit, polycomb repressive complex 2 subunit, IMMAS
Зовнішні ІД	OMIM: 606245 MGI: 1261758 HomoloGene: 32256 GeneCards: SUZ12
Онтологія гена
Молекулярна функція	• histone methyltransferase activity; • sequence-specific DNA binding; • chromatin binding; • зв'язування з іоном металу; • methylated histone binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; • chromatin DNA binding; • promoter-specific chromatin binding; • histone methyltransferase activity (H3-K27 specific); • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• sex chromatin; • ESC/E(Z) complex; • нуклеоплазма; • protein-DNA complex; • ядерце; • клітинне ядро; • RSC-type complex; • ядерні тільця;
Біологічний процес	• negative regulation of cell differentiation; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • negative regulation of gene expression, epigenetic; • positive regulation of cell population proliferation; • histone methylation; • histone ubiquitination; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • histone H3-K27 methylation; • negative regulation of G0 to G1 transition; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	23512
	52615
	ENSG00000178691
	ENSMUSG00000017548
	Q15022
	Q80U70
	NM_015355; NM_001321207
	NM_001163018; NM_199196
	NP_001308136; NP_056170
	NP_001156490; NP_954666
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SUZ12 (англ. SUZ12 polycomb repressive complex 2 subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 739 амінокислот, а молекулярна маса — 83 055^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPQKHGGGG	GGGSGPSAGS	GGGGFGGSAA	VAAATASGGK	SGGGSCGGGG
SYSASSSSSA	AAAAGAAVLP	VKKPKMEHVQ	ADHELFLQAF	EKPTQIYRFL
RTRNLIAPIF	LHRTLTYMSH	RNSRTNIKRK	TFKVDDMLSK	VEKMKGEQES
HSLSAHLQLT	FTGFFHKNDK	PSPNSENEQN	SVTLEVLLVK	VCHKKRKDVS
CPIRQVPTGK	KQVPLNPDLN	QTKPGNFPSL	AVSSNEFEPS	NSHMVKSYSL
LFRVTRPGRR	EFNGMINGET	NENIDVNEEL	PARRKRNRED	GEKTFVAQMT
VFDKNRRLQL	LDGEYEVAMQ	EMEECPISKK	RATWETILDG	KRLPPFETFS
QGPTLQFTLR	WTGETNDKST	APIAKPLATR	NSESLHQENK	PGSVKPTQTI
AVKESLTTDL	QTRKEKDTPN	ENRQKLRIFY	QFLYNNNTRQ	QTEARDDLHC
PWCTLNCRKL	YSLLKHLKLC	HSRFIFNYVY	HPKGARIDVS	INECYDGSYA
GNPQDIHRQP	GFAFSRNGPV	KRTPITHILV	CRPKRTKASM	SEFLESEDGE
VEQQRTYSSG	HNRLYFHSDT	CLPLRPQEME	VDSEDEKDPE	WLREKTITQI
EEFSDVNEGE	KEVMKLWNLH	VMKHGFIADN	QMNHACMLFV	ENYGQKIIKK
NLCRNFMLHL	VSMHDFNLIS	IMSIDKAVTK	LREMQQKLEK	GESASPANEE
ITEEQNGTAN	GFSEINSKEK	ALETDSVSGV	SKQSKKQKL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Weinmann A.S., Bartley S.M., Zhang T., Zhang M.Q., Farnham P.J. (2001). Use of chromatin immunoprecipitation to clone novel E2F target promoters. Mol. Cell. Biol. 21: 6820—6832. PMID 11564866 DOI:10.1128/MCB.21.20.6820-6832.2001
Kuzmichev A., Nishioka K., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. (2002). Histone methyltransferase activity associated with a human multiprotein complex containing the Enhancer of Zeste protein. Genes Dev. 16: 2893—2905. PMID 12435631 DOI:10.1101/gad.1035902
Pasini D., Bracken A.P., Jensen M.R., Lazzerini Denchi E., Helin K. (2004). Suz12 is essential for mouse development and for EZH2 histone methyltransferase activity. EMBO J. 23: 4061—4071. PMID 15385962 DOI:10.1038/sj.emboj.7600402
Kuzmichev A., Jenuwein T., Tempst P., Reinberg D. (2004). Different EZH2-containing complexes target methylation of histone H1 or nucleosomal histone H3. Mol. Cell. 14: 183—193. PMID 15099518 DOI:10.1016/S1097-2765(04)00185-6

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17101 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15022 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17101 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q15022 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

SUZ12

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук