SYF2

SYF2
Ідентифікатори
Символи	SYF2, CBPIN, NTC31, P29, fSAP29, SYF2 pre-mRNA splicing factor
Зовнішні ІД	OMIM: 607090 MGI: 1915842 HomoloGene: 5993 GeneCards: SYF2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • Prp19 complex • клітинне ядро • post-mRNA release spliceosomal complex • нуклеоплазма • nuclear speck • U2-type catalytic step 2 spliceosome Біологічний процес • mRNA processing • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling • in utero embryonic development • гаструляція • Сплайсинг РНК • positive regulation of cell population proliferation • embryonic organ development • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25949	68592
Ensembl	ENSG00000117614	ENSMUSG00000028821
UniProt	O95926	Q9D198
RefSeq (мРНК)	NM_207170 NM_015484	NM_026780
RefSeq (білок)	NP_056299 NP_997053	NP_081056
Локус (UCSC)	Хр. 1: 25.22 – 25.23 Mb	Хр. 4: 134.66 – 134.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SYF2 (англ. SYF2 pre-mRNA splicing factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 243 амінокислот, а молекулярна маса — 28 722.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAIAASEVL		VDSAEEGSLA		AAAELAAQKR		EQRLRKFREL		HLMRNEARKL
NHQEVVEEDK		RLKLPANWEA		KKARLEWELK		EEEKKKECAA		RGEDYEKVKL
LEISAEDAER		WERKKKRKNP		DLGFSDYAAA		QLRQYHRLTK		QIKPDMETYE
RLREKHGEEF		FPTSNSLLHG		THVPSTEEID		RMVIDLEKQI		EKRDKYSRRR
PYNDDADIDY		INERNAKFNK		KAERFYGKYT		AEIKQNLERG		TAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Chang M.-S., Chang C.-L., Huang C.-J., Yang Y.-C. (2000). p29, a novel GCIP-interacting protein, localizes in the nucleus. Biochem. Biophys. Res. Commun. 279: 732—737. PMID 11118353 DOI:10.1006/bbrc.2000.3992
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Див. також

• Хромосома 1