SYN3

SYN3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2P0A
Ідентифікатори
Символи	SYN3, synapsin III
Зовнішні ІД	OMIM: 602705 MGI: 1351334 HomoloGene: 68320 GeneCards: SYN3
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ATP binding Клітинна компонента • міжклітинні контакти • синапс • synaptic vesicle membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • Синаптичні бульбашки • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • glutamatergic synapse Біологічний процес • regulation of synaptic transmission, GABAergic • GO:0010554 neurotransmitter secretion • synaptic vesicle clustering • synaptic vesicle cycle Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8224	27204
Ensembl	ENSG00000185666	ENSMUSG00000059602
UniProt	O14994	Q8JZP2
RefSeq (мРНК)	NM_001135774 NM_003490 NM_133632 NM_133633 NM_001369907 NM_001369908 NM_001369909 NM_001369910	NM_001164495 NM_013722
RefSeq (білок)	NP_001129246 NP_003481 NP_598344 NP_001356836 NP_001356837 NP_001356838 NP_001356839	NP_001157967 NP_038750
Локус (UCSC)	Хр. 22: 32.51 – 33.06 Mb	Хр. 10: 86.06 – 86.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SYN3 (англ. Synapsin III) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 580 амінокислот, а молекулярна маса — 63 303.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNFLRRRLSD		SSFMANLPNG		YMTDLQRPDS		STSSPASPAM		ERRHPQPLAA
SFSSPGSSLF		SSLSSAMKQA		PQATSGLMEP		PGPSTPIVQR		PRILLVIDDA
HTDWSKYFHG		KKVNGEIEIR		VEQAEFSELN		LAAYVTGGCM		VDMQVVRNGT
KVVSRSFKPD		FILVRQHAYS		MALGEDYRSL		VIGLQYGGLP		AVNSLYSVYN
FCSKPWVFSQ		LIKIFHSLGP		EKFPLVEQTF		FPNHKPMVTA		PHFPVVVKLG
HAHAGMGKIK		VENQLDFQDI		TSVVAMAKTY		ATTEAFIDSK		YDIRIQKIGS
NYKAYMRTSI		SGNWKANTGS		AMLEQVAMTE		RYRLWVDSCS		EMFGGLDICA
VKAVHSKDGR		DYIIEVMDSS		MPLIGEHVEE		DRQLMADLVV		SKMSQLPMPG
GTAPSPLRPW		APQIKSAKSP		GQAQLGPQLG		QPQPRPPPQG		GPRQAQSPQP
QRSGSPSQQR		LSPQGQQPLS		PQSGSPQQQR		SPGSPQLSRA		SSGSSPNQAS
KPGATLASQP		RPPVQGRSTS		QQGEESKKPA		PPHPHLNKSQ		SLTNSLSTSD
TSQRGTPSED		EAKAETIRNL		RKSFASLFSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Porton B., Ferreira A., DeLisi L.E., Kao H.T. (2004). A rare polymorphism affects a mitogen-activated protein kinase site in synapsin III: possible relationship to schizophrenia. Biol. Psychiatry. 55: 118—125. PMID 14732590 DOI:10.1016/j.biopsych.2003.07.002

Див. також

• Хромосома 22