SYTL4

SYTL4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CSZ, 3FDW
Ідентифікатори
Символи	SYTL4, SLP4, synaptotagmin like 4
Зовнішні ІД	OMIM: 300723 MGI: 1351606 HomoloGene: 8454 GeneCards: SYTL4
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • clathrin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium-dependent phospholipid binding • syntaxin binding • phospholipid binding • neurexin family protein binding Клітинна компонента • ендосома • exocytic vesicle • мембрана • transport vesicle membrane • secretory granule • нуклеоплазма • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • presynapse • extrinsic component of membrane • центр організації мікротрубочок • гіалоплазма • клітинна мембрана • platelet alpha granule membrane • синапс Біологічний процес • negative regulation of insulin secretion • multivesicular body sorting pathway • positive regulation of protein secretion • positive regulation of exocytosis • intracellular protein transport • екзоцитоз • vesicle fusion • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • platelet degranulation • plasma membrane repair Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	94121	27359
Ensembl	ENSG00000102362	ENSMUSG00000031255
UniProt	Q96C24	Q9R0Q1
RefSeq (мРНК)	NM_001129896 NM_001174068 NM_080737	NM_001290717 NM_001290718 NM_001290719 NM_013757
RefSeq (білок)	NP_001123368 NP_001167539 NP_542775 NP_001357089 NP_001357090 NP_001357091 NP_001357092 NP_001357093 NP_001357094 NP_001357095 NP_001357096 NP_001357097 NP_001357098	NP_001277646 NP_001277647 NP_001277648 NP_038785
Локус (UCSC)	Хр. X: 100.67 – 100.73 Mb	Хр. X: 132.84 – 132.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SYTL4 (англ. Synaptotagmin like 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 671 амінокислот, а молекулярна маса — 76 024.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSELLDLSFL		SEEEKDLILS		VLQRDEEVRK		ADEKRIRRLK		NELLEIKRKG
AKRGSQHYSD		RTCARCQESL		GRLSPKTNTC		RGCNHLVCRD		CRIQESNGTW
RCKVCAKEIE		LKKATGDWFY		DQKVNRFAYR		TGSEIIRMSL		RHKPAVSKRE
TVGQSLLHQT		QMGDIWPGRK		IIQERQKEPS		VLFEVPKLKS		GKSALEAESE
SLDSFTADSD		STSRRDSLDK		SGLFPEWKKM		SAPKSQVEKE		TQPGGQNVVF
VDEGEMIFKK		NTRKILRPSE		YTKSVIDLRP		EDVVHESGSL		GDRSKSVPGL
NVDMEEEEEE		EDIDHLVKLH		RQKLARSSMQ		SGSSMSTIGS		MMSIYSEAGD
FGNIFVTGRI		AFSLKYEQQT		QSLVVHVKEC		HQLAYADEAK		KRSNPYVKTY
LLPDKSRQGK		RKTSIKRDTI		NPLYDETLRY		EIPESLLAQR		TLQFSVWHHG
RFGRNTFLGE		AEIQMDSWKL		DKKLDHCLPL		HGKISAESPT		GLPSHKGELV
VSLKYIPASK		TPVGGDRKKS		KGGEGGELQV		WIKEAKNLTA		AKAGGTSDSF
VKGYLLPMRN		KASKRKTPVM		KKTLNPHYNH		TFVYNGVRLE		DLQHMCLELT
VWDREPLASN		DFLGGVRLGV		GTGISNGEVV		DWMDSTGEEV		SLWQKMRQYP
GSWAEGTLQL		RSSMAKQKLG		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома X