TAF1C

TAF1C
Ідентифікатори
Символи	TAF1C, MGC:39976, SL1, TAFI110, TAFI95, TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit C
Зовнішні ІД	OMIM: 604905 MGI: 109576 HomoloGene: 21163 GeneCards: TAF1C
Пов'язані генетичні захворювання
аутизм
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001187 RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • RNA polymerase I transcription regulator complex • fibrillar center • Нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро Біологічний процес • termination of RNA polymerase I transcription • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • regulation of transcription by RNA polymerase I • RNA polymerase I preinitiation complex assembly • transcription by RNA polymerase I • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9013	21341
Ensembl	ENSG00000103168	ENSMUSG00000031832
UniProt	Q15572	Q6PDZ2
RefSeq (мРНК)	NM_001243156 NM_001243157 NM_001243158 NM_001243159 NM_001243160 NM_005679 NM_139353	NM_021441 NM_001378901
RefSeq (білок)	NP_001230085 NP_001230086 NP_001230087 NP_001230088 NP_001230089 NP_005670 NP_647610	NP_067416 NP_001365830
Локус (UCSC)	Хр. 16: 84.18 – 84.19 Mb	Хр. 8: 120.32 – 120.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TAF1C (англ. TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 869 амінокислот, а молекулярна маса — 95 213.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDFPSSLRPA		LFLTGPLGLS		DVPDLSFMCS		WRDALTLPEA		QPQNSENGAL
HVTKDLLWEP		ATPGPLPMLP		PLIDPWDPGL		TARDLLFRGG		CRYRKRPRVV
LDVTEQISRF		LLDHGDVAFA		PLGKLMLENF		KLEGAGSRTK		KKTVVSVKKL
LQDLGGHQPW		GCPWAYLSNR		QRRFSILGGP		ILGTSVASHL		AELLHEELVL
RWEQLLLDEA		CTGGALAWVP		GRTPQFGQLV		YPAGGAQDRL		HFQEVVLTPG
DNPQFLGKPG		RIQLQGPVRQ		VVTCTVQGES		KALIYTFLPH		WLTCYLTPGP
FHPSSALLAV		RSDYHCAVWK		FGKQWQPTLL		QAMQVEKGAT		GISLSPHLPG
ELAICSRSGA		VCLWSPEDGL		RQIYRDPETL		VFRDSSSWRW		ADFTAHPRVL
TVGDRTGVKM		LDTQGPPGCG		LLLFRLGAEA		SCQKGERVLL		TQYLGHSSPK
CLPPTLHLVC		TQFSLYLVDE		RLPLVPMLKW		NHGLPSPLLL		ARLLPPPRPS
CVQPLLLGGQ		GGQLQLLHLA		GEGASVPRLA		GPPQSLPSRI		DSLPAFPLLE
PKIQWRLQER		LKAPTIGLAA		VVPPLPSAPT		PGLVLFQLSA		AGDVFYQQLR
PQVDSSLRRD		AGPPGDTQPD		CHAPTASWTS		QDTAGCSQWL		KALLKVPLAP
PVWTAPTFTH		RQMLGSTELR		REEEEGQRLG		VLRKAMARGQ		LLLQRDLGSL
PAAEPPPAPE		SGLEDKLSER		LGEAWAGRGA		AWWERQQGRT		SEPGRQTRRP
KRRTQLSSSF		SLSGHVDPSE		DTSSPHSPEW		PPADALPLPP		TTPPSQELTP
DACAQGVPSE		QRQMLRDYMA		KLPPQRDTPG		CATTPPHSQA		SSVRATRSQQ
HTPVLSSSQP		LRKKPRMGF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhai W., Comai L. (2000). Repression of RNA polymerase I transcription by the tumor suppressor p53. Mol. Cell. Biol. 20: 5930—5938. PMID 10913176 DOI:10.1128/MCB.20.16.5930-5938.2000
• Friedrich J.K., Panov K.I., Cabart P., Russell J., Zomerdijk J.C.B.M. (2005). TBP-TAF complex SL1 directs RNA polymerase I pre-initiation complex formation and stabilizes upstream binding factor at the rDNA promoter. J. Biol. Chem. 280: 29551—29558. PMID 15970593 DOI:10.1074/jbc.M501595200

Див. також

• Хромосома 16