TCEA2

TCEA2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LW4
Ідентифікатори
Символи	TCEA2, TFIIS, transcription elongation factor A2
Зовнішні ІД	OMIM: 604784 MGI: 107368 HomoloGene: 68304 GeneCards: TCEA2
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • translation elongation factor activity Клітинна компонента • transcription elongation factor complex • клітинне ядро Біологічний процес • DNA-templated transcription, elongation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of DNA-templated transcription, elongation • translational elongation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6919	21400
Ensembl	ENSG00000171703	ENSMUSG00000059540
UniProt	Q15560 Q6IB64	Q9QVN7
RefSeq (мРНК)	NM_003195 NM_198723	NM_009326 NM_001356342 NM_001356343
RefSeq (білок)	NP_003186 NP_942016 NP_003186.1	NP_033352 NP_001343271 NP_001343272
Локус (UCSC)	Хр. 20: 64.05 – 64.07 Mb	Хр. 2: 181.32 – 181.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TCEA2 (англ. Transcription elongation factor A2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 299 амінокислот, а молекулярна маса — 33 601.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMGKEEEIAR		IARRLDKMVT		KKSAEGAMDL		LRELKAMPIT		LHLLQSTRVG
MSVNALRKQS		SDEEVIALAK		SLIKSWKKLL		DASDAKARER		GRGMPLPTSS
RDASEAPDPS		RKRPELPRAP		STPRITTFPP		VPVTCDAVRN		KCREMLTAAL
QTDHDHVAIG		ADCERLSAQI		EECIFRDVGN		TDMKYKNRVR		SRISNLKDAK
NPDLRRNVLC		GAITPQQIAV		MTSEEMASDE		LKEIRKAMTK		EAIREHQMAR
TGGTQTDLFT		CGKCRKKNCT		YTQVQTRSSD		EPMTTFVVCN		ECGNRWKFC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Umehara T., Kida S., Yamamoto T., Horikoshi M. (1995). Isolation and characterization of a cDNA encoding a new type of human transcription elongation factor S-II. Gene. 167: 297—302. PMID 8566795 DOI:10.1016/0378-1119(95)00634-6
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Weaver Z.A., Kane C.M. (1997). Genomic characterization of a testis-specific TFIIS (TCEA2) gene. Genomics. 46: 516—519. PMID 9441762 DOI:10.1006/geno.1997.5073
• Sijbrandi R., Fiedler U., Timmers H.T.M. (2002). RNA polymerase II complexes in the very early phase of transcription are not susceptible to TFIIS-induced exonucleolytic cleavage. Nucleic Acids Res. 30: 2290—2298. PMID 12034815 DOI:10.1093/nar/30.11.2290

Див. також

• Хромосома 20