TCERG1

TCERG1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DK7, 2DOD, 2DOE, 2DOF, 2E71, 2KIQ, 2KIS, 2MW9, 2MWA, 2MWB, 2MWD, 2MWF, 2NNT, 3HFH, 3Q1I, 4FQG, 2N4R, 2N4S, 2N4T, 2N4U, 2N4V, 2N4W
Ідентифікатори
Символи	TCERG1, CA150, TAF2S, Urn1, transcription elongation regulator 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605409 MGI: 1926421 HomoloGene: 4879 GeneCards: TCERG1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • proline-rich region binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • identical protein binding • RNA polymerase binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10915	56070
Ensembl	ENSG00000113649	ENSMUSG00000024498
UniProt	O14776	Q8CGF7
RefSeq (мРНК)	NM_001040006 NM_006706 NM_001382548	NM_001039474 NM_001289526 NM_001360881 NM_019512
RefSeq (білок)	NP_001035095 NP_006697 NP_001369477	NP_001034563 NP_001276455 NP_001347810
Локус (UCSC)	Хр. 5: 146.45 – 146.51 Mb	Хр. 18: 42.64 – 42.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TCERG1 (англ. Transcription elongation regulator 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 098 амінокислот, а молекулярна маса — 123 901.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAERGGDGGE		SERFNPGELR		MAQQQALRFR		GPAPPPNAVM		RGPPPLMRPP
PPFGMMRGPP		PPPRPPFGRP		PFDPNMPPMP		PPGGIPPPMG		PPHLQRPPFM
PPPMSSMPPP		PGMMFPPGMP		PVTAPGTPAL		PPTEEIWVEN		KTPDGKVYYY
NARTRESAWT		KPDGVKVIQQ		SELTPMLAAQ		AQVQAQAQAQ		AQAQAQAQAQ
AQAQAQAQAQ		AQAQAQAQAQ		AQAQAQAQAQ		AQAQAQAQAQ		AQVQAQVQAQ
VQAQAVGAST		PTTSSPAPAV		STSTSSSTPS		STTSTTTTAT		SVAQTVSTPT
TQDQTPSSAV		SVATPTVSVS		TPAPTATPVQ		TVPQPHPQTL		PPAVPHSVPQ
PTTAIPAFPP		VMVPPFRVPL		PGMPIPLPGV		AMMQIVSCPY		VKTVATTKTG
VLPGMAPPIV		PMIHPQVAIA		ASPATLAGAT		AVSEWTEYKT		ADGKTYYYNN
RTLESTWEKP		QELKEKEKLE		EKIKEPIKEP		SEEPLPMETE		EEDPKEEPIK
EIKEEPKEEE		MTEEEKAAQK		AKPVATAPIP		GTPWCVVWTG		DERVFFYNPT
TRLSMWDRPD		DLIGRADVDK		IIQEPPHKKG		MEELKKLRHP		TPTMLSIQKW
QFSMSAIKEE		QELMEEINED		EPVKAKKRKR		DDNKDIDSEK		EAAMEAEIKA
ARERAIVPLE		ARMKQFKDML		LERGVSAFST		WEKELHKIVF		DPRYLLLNPK
ERKQVFDQYV		KTRAEEERRE		KKNKIMQAKE		DFKKMMEEAK		FNPRATFSEF
AAKHAKDSRF		KAIEKMKDRE		ALFNEFVAAA		RKKEKEDSKT		RGEKIKSDFF
ELLSNHHLDS		QSRWSKVKDK		VESDPRYKAV		DSSSMREDLF		KQYIEKIAKN
LDSEKEKELE		RQARIEASLR		EREREVQKAR		SEQTKEIDRE		REQHKREEAI
QNFKALLSDM		VRSSDVSWSD		TRRTLRKDHR		WESGSLLERE		EKEKLFNEHI
EALTKKKREH		FRQLLDETSA		ITLTSTWKEV		KKIIKEDPRC		IKFSSSDRKK
QREFEEYIRD		KYITAKADFR		TLLKETKFIT		YRSKKLIQES		DQHLKDVEKI
LQNDKRYLVL		DCVPEERRKL		IVAYVDDLDR		RGPPPPPTAS		EPTRRSTK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Carty S.M., Goldstrohm A.C., Sune C., Garcia-Blanco M.A., Greenleaf A.L. (2000). Protein-interaction modules that organize nuclear function: FF domains of CA150 bind the phosphoCTD of RNA polymerase II. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 9015—9020. PMID 10908677 DOI:10.1073/pnas.160266597
• Goldstrohm A.C., Albrecht T.R., Sune C., Bedford M.T., Garcia-Blanco M.A. (2001). The transcription elongation factor CA150 interacts with RNA polymerase II and the pre-mRNA splicing factor SF1. Mol. Cell. Biol. 21: 7617—7628. PMID 11604498 DOI:10.1128/MCB.21.22.7617-7628.2001
• Smith M.J., Kulkarni S., Pawson T. (2004). FF domains of CA150 bind transcription and splicing factors through multiple weak interactions. Mol. Cell. Biol. 24: 9274—9285. PMID 15485897 DOI:10.1128/MCB.24.21.9274-9285.2004
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 5