TCF20

TCF20
Ідентифікатори
Символи	TCF20, AR1, SPBP, TCF-20, transcription factor 20 (AR1), transcription factor 20, DDVIBA
Зовнішні ІД	OMIM: 603107 MGI: 108399 HomoloGene: 4131 GeneCards: TCF20
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • зв'язування з іоном металу • RNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • ядерні тільця • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6942	21411
Ensembl	ENSG00000283681 ENSG00000281897 ENSG00000262024 ENSG00000282892 ENSG00000283026 ENSG00000280467 ENSG00000100207 ENSG00000276461	ENSMUSG00000041852
UniProt	Q9UGU0	Q9EPQ8
RefSeq (мРНК)	NM_005650 NM_181492 NM_001378418	NM_001114140 NM_013836
RefSeq (білок)	NP_005641 NP_852469 NP_001365347	NP_001107612 NP_038864 NP_001389767
Локус (UCSC)	Хр. 22: 42.16 – 42.34 Mb	Хр. 15: 82.69 – 82.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TCF20 (англ. Transcription factor 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 960 амінокислот, а молекулярна маса — 211 771.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQSFREQSSY		HGNQQSYPQE		VHGSSRLEEF		SPRQAQMFQN		FGGTGGSSGS
SGSGSGGGRR		GAAAAAAAMA		SETSGHQGYQ		GFRKEAGDFY		YMAGNKDPVT
TGTPQPPQRR		PSGPVQSYGP		PQGSSFGNQY		GSEGHVGQFQ		AQHSGLGGVS
HYQQDYTGPF		SPGSAQYQQQ		ASSQQQQQQV		QQLRQQLYQS		HQPLPQATGQ
PASSSSHLQP		MQRPSTLPSS		AAGYQLRVGQ		FGQHYQSSAS		SSSSSSFPSP
QRFSQSGQSY		DGSYNVNAGS		QYEGHNVGSN		AQAYGTQSNY		SYQPQSMKNF
EQAKIPQGTQ		QGQQQQQPQQ		QQHPSQHVMQ		YTNAATKLPL		QSQVGQYNQP
EVPVRSPMQF		HQNFSPISNP		SPAASVVQSP		SCSSTPSPLM		QTGENLQCGQ
GSVPMGSRNR		ILQLMPQLSP		TPSMMPSPNS		HAAGFKGFGL		EGVPEKRLTD
PGLSSLSALS		TQVANLPNTV		QHMLLSDALT		PQKKTSKRPS		SSKKADSCTN
SEGSSQPEEQ		LKSPMAESLD		GGCSSSSEDQ		GERVRQLSGQ		STSSDTTYKG
GASEKAGSSP		AQGAQNEPPR		LNASPAAREE		ATSPGAKDMP		LSSDGNPKVN
EKTVGVIVSR		EAMTGRVEKP		GGQDKGSQED		DPAATQRPPS		NGGAKETSHA
SLPQPEPPGG		GGSKGNKNGD		NNSNHNGEGN		GQSGHSAAGP		GFTSRTEPSK
SPGSLRYSYK		DSFGSAVPRN		VSGFPQYPTG		QEKGDFTGHG		ERKGRNEKFP
SLLQEVLQGY		HHHPDRRYSR		STQEHQGMAG		SLEGTTRPNV		LVSQTNELAS
RGLLNKSIGS		LLENPHWGPW		ERKSSSTAPE		MKQINLTDYP		IPRKFEIEPQ
SSAHEPGGSL		SERRSVICDI		SPLRQIVRDP		GAHSLGHMSA		DTRIGRNDRL
NPTLSQSVIL		PGGLVSMETK		LKSQSGQIKE		EDFEQSKSQA		SFNNKKSGDH
CHPPSIKHES		YRGNASPGAA		THDSLSDYGP		QDSRPTPMRR		VPGRVGGREG
MRGRSPSQYH		DFAEKLKMSP		GRSRGPGGDP		HHMNPHMTFS		ERANRSSLHT
PFSPNSETLA		SAYHANTRAH		AYGDPNAGLN		SQLHYKRQMY		QQQPEEYKDW
SSGSAQGVIA		AAQHRQEGPR		KSPRQQQFLD		RVRSPLKNDK		DGMMYGPPVG
TYHDPSAQEA		GRCLMSSDGL		PNKGMELKHG		SQKLQESCWD		LSRQTSPAKS
SGPPGMSSQK		RYGPPHETDG		HGLAEATQSS		KPGSVMLRLP		GQEDHSSQNP
LIMRRRVRSF		ISPIPSKRQS		QDVKNSSTED		KGRLLHSSKE		GADKAFNSYA
HLSHSQDIKS		IPKRDSSKDL		PSPDSRNCPA		VTLTSPAKTK		ILPPRKGRGL
KLEAIVQKIT		SPNIRRSASS		NSAEAGGDTV		TLDDILSLKS		GPPEGGSVAV
QDADIEKRKG		EVASDLVSPA		NQELHVEKPL		PRSSEEWRGS		VDDKVKTETH
AETVTAGKEP		PGAMTSTTSQ		KPGSNQGRPD		GSLGGTAPLI		FPDSKNVPPV
GILAPEANPK		AEEKENDTVT		ISPKQEGFPP		KGYFPSGKKK		GRPIGSVNKQ
KKQQQPPPPP		PQPPQIPEGS		ADGEPKPKKQ		RQRRERRKPG		AQPRKRKTKQ
AVPIVEPQEP		EIKLKYATQP		LDKTDAKNKS		FYPYIHVVNK		CELGAVCTII
NAEEEEQTKL		VRGRKGQRSL		TPPPSSTESK		ALPASSFMLQ		GPVVTESSVM
GHLVCCLCGK		WASYRNMGDL		FGPFYPQDYA		ATLPKNPPPK		RATEMQSKVK
VRHKSASNGS		KTDTEEEEEQ		QQQQKEQRSL		AAHPRFKRRH		RSEDCGGGPR
SLSRGLPCKK		AATEGSSEKT		VLDSKPSVPT		TSEGGPELEL		QIPELPLDSN
EFWVHEGCIL		WANGIYLVCG		RLYGLQEALE		IAREMKCSHC		QEAGATLGCY
NKGCSFRYHY		PCAIDADCLL		HEENFSVRCP		KHKPPLPCPL		PPLQNKTAKG
SLSTEQSERG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Rekdal C., Sjoettem E., Johansen T. (2000). The nuclear factor SPBP contains different functional domains and stimulates the activity of various transcriptional activators. J. Biol. Chem. 275: 40288—40300. PMID 10995766 DOI:10.1074/jbc.M006978200
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 22