TDRD5

TDRD5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3S93
Ідентифікатори
Символи	TDRD5, TUDOR3, tudor domain containing 5
Зовнішні ІД	OMIM: 617748 MGI: 2684949 HomoloGene: 18312 GeneCards: TDRD5
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	163589	214575
Ensembl	ENSG00000162782	ENSMUSG00000060985
UniProt	Q8NAT2	Q5VCS6
RefSeq (мРНК)	NM_001199085 NM_001199089 NM_001199091 NM_001199092 NM_173533 NM_001349923	NM_001134741 NM_001277730
RefSeq (білок)	NP_001186014 NP_001186018 NP_001186020 NP_001186021 NP_775804 NP_001336852	NP_001128213 NP_001264659
Локус (UCSC)	Хр. 1: 179.59 – 179.69 Mb	Хр. 1: 156.08 – 156.13 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TDRD5 (англ. Tudor domain containing 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 981 амінокислот, а молекулярна маса — 109 737.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSEQERIQEC		LRKEIRSLLI		STKDGLSPQE		LEKEYLLMVG		NHLPLRILGY
RSTMELVLDM		PDVVRVCPGA		GGTVILKAIP		DESTKGIASL		VAKQRSSHKL
RNSMHKGRPS		IYSGPRSHRR		VPYRGRVAPI		LPAVVKSELK		DLLALSPVLL
SDFEKAFAKR		FGRSFQYMQY		GFLSMFEVLN		AASDVISVEQ		TRAGSLLMLK
KSVTEEKPRG		CPAGKIFTQP		FRMKQGSYST		GFPVAKPCFS		QPTSNMEPPK
QIMSMEKTSK		LNVVETSRLN		HTEKLNQLEN		TFKSVIAQIG		PGGTISSELK
HKIKFVVSKF		PEGLFISKLL		GEYEVIFKEQ		LSPKKLGFLN		VTELVGALSD
ILHVEFRKGH		QDLLVFDADK		KPLPPVQSDK		KIEAKACVSS		PPRNSLSTAA
VKETVWNCPS		KKQKEPQQKI		CKKPNLVVKP		LQLQVETNKS		ELNLAMANHD
IPPDAVPNKK		LCRLPPLDTS		SLIGVFVEYI		ISPSQFYIRI		YSRDSSELLE
DMMIEMRRCY		SNQLVSDRYV		MPECFIQPGH		LCCVRISEDK		WWYRVIIHRV
LEKQEVEVFY		PDFGNIGIVQ		KSSLRFLKCC		YTKLPAQAIP		CSLAWVRPVE
EHWTSKAILQ		FQKLCGLKPL		VGVVDEYVDG		ILNIFLCDTS		SNEDVYFHHV
LRTEGHAIVC		RENISSKGFS		ELNPLALYTT		SSGGPEDIVL		TELGYPSQQH
YFNEDRKISP		QSKESELRIL		DEIPTGMPCL		ESVTIGDDIW		DENWLPLQAK
MGKGGDAASH		LFTASLGGKN		QYSSCKEMPQ		KDWCFSTPKD		TWDDSWQPSG
LVNGTKVEVH		KPEVLGAQEK		NTGTNRTQKQ		LDINGSSDSS		TLPKLEEFCT
SLTQSEQSAD		GSQSEPNNSQ		TQPKQIQLST		AAPCSTTAVD		DSAEKPSGSV
ESSPEILKNE		DFSSSRAITL		YKDKRQESVD		QLSLILSYEC		QISQKLYIPR
STATAALGAA		ARLATSRSLL		HWYPSVKRME		A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Anantharaman V., Zhang D., Aravind L. (2010). OST-HTH: a novel predicted RNA-binding domain. Biol. Direct. 5: 13—13. PMID 20302647 DOI:10.1186/1745-6150-5-13
• Callebaut I., Mornon J.P. (2010). LOTUS, a new domain associated with small RNA pathways in the germline. Bioinformatics. 26: 1140—1144. PMID 20305267 DOI:10.1093/bioinformatics/btq122

Див. також

• Хромосома 1