TDRD7

TDRD7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3RCO
Ідентифікатори
Символи	TDRD7, CATC4, CTRCT36, PCTAIRE2BP, TRAP, tudor domain containing 7
Зовнішні ІД	OMIM: 611258 MGI: 2140279 HomoloGene: 8618 GeneCards: TDRD7
Пов'язані генетичні захворювання
cataract 36
Онтологія гена Молекулярна функція • mRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein N-terminus binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • chromatoid body • мітохондріальний матрикс • ribonucleoprotein granule Біологічний процес • posttranscriptional regulation of gene expression • диференціація клітин • lens fiber cell differentiation • lens morphogenesis in camera-type eye • Сперматогенез Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23424	100121
Ensembl	ENSG00000196116	ENSMUSG00000035517
UniProt	Q8NHU6	Q8K1H1
RefSeq (мРНК)	NM_001302884 NM_014290	NM_001290475 NM_146142 NM_001355189
RefSeq (білок)	NP_001289813 NP_055105	NP_001277404 NP_666254 NP_001342118
Локус (UCSC)	Хр. 9: 97.41 – 97.5 Mb	Хр. 4: 45.97 – 46.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TDRD7 (англ. Tudor domain containing 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 098 амінокислот, а молекулярна маса — 123 586.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLEGDLVSKM		LRAVLQSHKN		GVALPRLQGE		YRSLTGDWIP		FKQLGFPTLE
AYLRSVPAVV		RIETSRSGEI		TCYAMACTET		ARIAQLVARQ		RSSKRKTGRQ
VNCQMRVKKT		MPFFLEGKPK		ATLRQPGFAS		NFSVGKKPNP		APLRDKGNSV
GVKPDAEMSP		YMLHTTLGNE		AFKDIPVQRH		VTMSTNNRFS		PKASLQPPLQ
MHLSRTSTKE		MSDNLNQTVE		KPNVKPPASY		TYKMDEVQNR		IKEILNKHNN
GIWISKLPHF		YKELYKEDLN		QGILQQFEHW		PHICTVEKPC		SGGQDLLLYP
AKRKQLLRSE		LDTEKVPLSP		LPGPKQTPPL		KGCPTVMAGD		FKEKVADLLV
KYTSGLWASA		LPKAFEEMYK		VKFPEDALKN		LASLSDVCSI		DYISGNPQKA
ILYAKLPLPT		DKIQKDAGQA		HGDNDIKAMV		EQEYLQVEES		IAESANTFME
DITVPPLMIP		TEASPSVLVV		ELSNTNEVVI		RYVGKDYSAA		QELMEDEMKE
YYSKNPKITP		VQAVNVGQLL		AVNAEEDAWL		RAQVISTEEN		KIKVCYVDYG
FSENVEKSKA		YKLNPKFCSL		SFQATKCKLA		GLEVLSDDPD		LVKVVESLTC
GKIFAVEILD		KADIPLVVLY		DTSGEDDINI		NATCLKAICD		KSLEVHLQVD
AMYTNVKVTN		ICSDGTLYCQ		VPCKGLNKLS		DLLRKIEDYF		HCKHMTSECF
VSLPFCGKIC		LFHCKGKWLR		VEITNVHSSR		ALDVQFLDSG		TVTSVKVSEL
REIPPRFLQE		MIAIPPQAIK		CCLADLPQSI		GMWTPDAVLW		LRDSVLNCSD
CSIKVTKVDE		TRGIAHVYLF		TPKNFPDPHR		SINRQITNAD		LWKHQKDVFL
SAISSGADSP		NSKNGNMPMS		GNTGENFRKN		LTDVIKKSMV		DHTSAFSTEE
LPPPVHLSKP		GEHMDVYVPV		ACHPGYFVIQ		PWQEIHKLEV		LMEEMILYYS
VSEERHIAVE		KDQVYAAKVE		NKWHRVLLKG		ILTNGLVSVY		ELDYGKHELV
NIRKVQPLVD		MFRKLPFQAV		TAQLAGVKCN		QWSEEASMVF		RNHVEKKPLV
ALVQTVIENA		NPWDRKVVVY		LVDTSLPDTD		TWIHDFMSEY		LIELSKVN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Callebaut I., Mornon J.P. (2010). LOTUS, a new domain associated with small RNA pathways in the germline. Bioinformatics. 26: 1140—1144. PMID 20305267 DOI:10.1093/bioinformatics/btq122
• Anantharaman V., Zhang D., Aravind L. (2010). OST-HTH: a novel predicted RNA-binding domain. Biol. Direct. 5: 13—13. PMID 20302647 DOI:10.1186/1745-6150-5-13

Див. також

• Хромосома 9