TEF

TEF
Ідентифікатори
Символи	TEF, PAR bZIP transcription factor, TEF transcription factor, PAR bZIP family member
Зовнішні ІД	OMIM: 188595 MGI: 98663 HomoloGene: 31140 GeneCards: TEF
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • double-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • ритмічний процес • transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7008	21685
Ensembl	ENSG00000167074	ENSMUSG00000022389
UniProt	Q10587	Q9JLC6
RefSeq (мРНК)	NM_003216 NM_001145398	NM_017376 NM_153484
RefSeq (білок)	NP_001138870 NP_003207	NP_059072 NP_705617
Локус (UCSC)	Хр. 22: 41.37 – 41.4 Mb	Хр. 15: 81.69 – 81.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TEF (англ. TEF, PAR bZIP transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 303 амінокислот, а молекулярна маса — 33 248.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDAGGGKKP		PVDPQAGPGP		GPGRAAGERG		LSGSFPLVLK		KLMENPPREA
RLDKEKGKEK		LEEDEAAAAS		TMAVSASLMP		PIWDKTIPYD		GESFHLEYMD
LDEFLLENGI		PASPTHLAHN		LLLPVAELEG		KESASSSTAS		PPSSSTAIFQ
PSETVSSTES		SLEKERETPS		PIDPNCVEVD		VNFNPDPADL		VLSSVPGGEL
FNPRKHKFAE		EDLKPQPMIK		KAKKVFVPDE		QKDEKYWTRR		KKNNVAAKRS
RDARRLKENQ		ITIRAAFLEK		ENTALRTEVA		ELRKEVGKCK		TIVSKYETKY
GPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Khatib Z.A., Inaba T., Valentine M., Look A.T. (1994). Chromosomal localization and cDNA cloning of the human DBP and TEF genes. Genomics. 23: 344—351. PMID 7835883 DOI:10.1006/geno.1994.1510
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hunger S.P., Li S., Fall M.Z., Naumovski L., Cleary M.L. (1996). The proto-oncogene HLF and the related basic leucine zipper protein TEF display highly similar DNA-binding and transcriptional regulatory properties. Blood. 87: 4607—4617. PMID 8639829

Див. також

• Хромосома 22