TFDP1

TFDP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2AZE
Ідентифікатори
Символи	TFDP1, DP1, DRTF1, Dp-1, DILC, transcription factor Dp-1
Зовнішні ІД	OMIM: 189902 MGI: 101934 HomoloGene: 38276 GeneCards: TFDP1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • protein domain specific binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • transcription regulator complex • клітинне ядро • мітохондрія • Нуклеоплазма • гіалоплазма • цитоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of protein insertion into mitochondrial membrane involved in apoptotic signaling pathway • клітинний цикл • проліферація • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • transcription, DNA-templated • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of G0 to G1 transition • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of fat cell proliferation • epidermis development • anoikis • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of cell cycle • regulation of DNA biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7027	21781
Ensembl	ENSG00000198176	ENSMUSG00000038482
UniProt	Q14186	Q08639
RefSeq (мРНК)	NM_007111	NM_001291765 NM_001291766 NM_001291768 NM_009361 NM_001358991
RefSeq (білок)	NP_009042	NP_001278694 NP_001278695 NP_001278697 NP_033387 NP_001345920
Локус (UCSC)	Хр. 13: 113.58 – 113.64 Mb	Хр. 8: 13.34 – 13.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TFDP1 (англ. Transcription factor Dp-1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 410 амінокислот, а молекулярна маса — 45 070.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAKDAGLIEA		NGELKVFIDQ		NLSPGKGVVS		LVAVHPSTVN		PLGKQLLPKT
FGQSNVNIAQ		QVVIGTPQRP		AASNTLVVGS		PHTPSTHFAS		QNQPSDSSPW
SAGKRNRKGE		KNGKGLRHFS		MKVCEKVQRK		GTTSYNEVAD		ELVAEFSAAD
NHILPNESAY		DQKNIRRRVY		DALNVLMAMN		IISKEKKEIK		WIGLPTNSAQ
ECQNLEVERQ		RRLERIKQKQ		SQLQELILQQ		IAFKNLVQRN		RHAEQQASRP
PPPNSVIHLP		FIIVNTSKKT		VIDCSISNDK		FEYLFNFDNT		FEIHDDIEVL
KRMGMACGLE		SGSCSAEDLK		MARSLVPKAL		EPYVTEMAQG		TVGGVFITTA
GSTSNGTRFS		ASDLTNGADG		MLATSSNGSQ		YSGSRVETPV		SYVGEDDEED
DDFNENDEDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wu C.-L., Zukerberg L.R., Ngwu C., Harlow E., Lees J.A. (1995). In vivo association of E2F and DP family proteins. Mol. Cell. Biol. 15: 2536—2546. PMID 7739537 DOI:10.1128/MCB.15.5.2536
• Ogawa H., Ishiguro K., Gaubatz S., Livingston D.M., Nakatani Y. (2002). A complex with chromatin modifiers that occupies E2F- and Myc-responsive genes in G0 cells. Science. 296: 1132—1136. PMID 12004135 DOI:10.1126/science.1069861
• Zaragoza K., Begay V., Schuetz A., Heinemann U., Leutz A. (2010). Repression of transcriptional activity of C/EBPalpha by E2F-dimerization partner complexes. Mol. Cell. Biol. 30: 2293—2304. PMID 20176812 DOI:10.1128/MCB.01619-09

Див. також

• Хромосома 13