TGFB1I1

TGFB1I1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1KLA, 1KLC, 1KLD, 3KFD, 4KV5
Ідентифікатори
Символи	TGFB1I1, ARA55, HIC-5, HIC5, TSC-5, transforming growth factor beta 1 induced transcript 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602353 MGI: 102784 HomoloGene: 7572 GeneCards: TGFB1I1
Онтологія гена Молекулярна функція • I-SMAD binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • androgen receptor binding • Roundabout binding • GO:0001104 transcription coregulator activity Клітинна компонента • цитоплазма • focal adhesion • nuclear matrix • GO:0005578 Позаклітинна матриця • внутрішньоклітинний • Міжклітинні контакти • Цитоскелет • клітинне ядро • collagen-containing extracellular matrix • гіалоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • androgen receptor signaling pathway • positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • диференціація клітин • response to heat • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • Wnt signaling pathway • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition • ubiquitin-dependent SMAD protein catabolic process • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • адгезія клітин • negative regulation of cell population proliferation • morphogenesis of embryonic epithelium • epithelial cell differentiation • cell fate commitment • negative regulation of fat cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7041	21804
Ensembl	ENSG00000140682	ENSMUSG00000030782
UniProt	O43294	Q62219
RefSeq (мРНК)	NM_015927 NM_001042454 NM_001164719	NM_001289550 NM_001289551 NM_001289552 NM_001289553 NM_009365
RefSeq (білок)	NP_001035919 NP_001158191 NP_057011 NP_001158191.1 NP_057011.2	NP_001276479 NP_001276480 NP_001276481 NP_001276482
Локус (UCSC)	Хр. 16: 31.47 – 31.48 Mb	Хр. 7: 127.85 – 127.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TGFB1I1 (англ. Transforming growth factor beta 1 induced transcript 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 461 амінокислот, а молекулярна маса — 49 814.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEDLDALLSD		LETTTSHMPR		SGAPKERPAE		PLTPPPSYGH		QPQTGSGESS
GASGDKDHLY		STVCKPRSPK		PAAPAAPPFS		SSSGVLGTGL		CELDRLLQEL
NATQFNITDE		IMSQFPSSKV		ASGEQKEDQS		EDKKRPSLPS		SPSPGLPKAS
ATSATLELDR		LMASLSDFRV		QNHLPASGPT		QPPVVSSTNE		GSPSPPEPTG
KGSLDTMLGL		LQSDLSRRGV		PTQAKGLCGS		CNKPIAGQVV		TALGRAWHPE
HFVCGGCSTA		LGGSSFFEKD		GAPFCPECYF		ERFSPRCGFC		NQPIRHKMVT
ALGTHWHPEH		FCCVSCGEPF		GDEGFHEREG		RPYCRRDFLQ		LFAPRCQGCQ
GPILDNYISA		LSALWHPDCF		VCRECFAPFS		GGSFFEHEGR		PLCENHFHAR
RGSLCATCGL		PVTGRCVSAL		GRRFHPDHFT		CTFCLRPLTK		GSFQERAGKP
YCQPCFLKLF		G

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, сигнальний шлях Wnt, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ishino M., Aoto H., Sasaski H., Suzuki R., Sasaki T. (2000). Phosphorylation of Hic-5 at tyrosine 60 by CAKbeta and Fyn. FEBS Lett. 474: 179—183. PMID 10838081 DOI:10.1016/S0014-5793(00)01597-0
• Zhang J., Zhang L.-X., Meltzer P.S., Barrett J.C., Trent J.M. (2000). Molecular cloning of human Hic-5, a potential regulator involved in signal transduction and cellular senescence. Mol. Carcinog. 27: 177—183. PMID 10708479 DOI:10.1002/(SICI)1098-2744(200003)27:3<177::AID-MC4>3.3.CO;2-J
• Nishiya N., Tachibana K., Shibanuma M., Mashimo J.I., Nose K. (2001). Hic-5-reduced cell spreading on fibronectin: competitive effects between paxillin and Hic-5 through interaction with focal adhesion kinase. Mol. Cell. Biol. 21: 5332—5345. PMID 11463817 DOI:10.1128/MCB.21.16.5332-5345.2001
• Fujimoto N., Mizokami A., Harada S., Matsumoto T. (2001). Different expression of androgen receptor coactivators in human prostate. Urology. 58: 289—294. PMID 11489729 DOI:10.1016/S0090-4295(01)01117-7
• Kim-Kaneyama J.-R., Shibanuma M., Nose K. (2002). Transcriptional activation of the c-fos gene by a LIM protein, Hic-5. Biochem. Biophys. Res. Commun. 299: 360—365. PMID 12445807 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02644-X

Див. також

• Хромосома 16