TGIF1

TGIF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LK2
Ідентифікатори
Символи	TGIF1, HPE4, TGIF, TGFB induced factor homeobox 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602630 MGI: 1194497 HomoloGene: 7574 GeneCards: TGIF1
Пов'язані генетичні захворювання
періодонтит, holoprosencephaly 4
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • co-SMAD binding Клітинна компонента • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of gene expression • multicellular organism development • cellular response to growth factor stimulus • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7050	21815
Ensembl	ENSG00000177426	ENSMUSG00000047407
UniProt	Q15583	P70284
RefSeq (мРНК)	NM_001278682 NM_001278684 NM_001278686 NM_003244 NM_170695 NM_173207 NM_173208 NM_173209 NM_173210 NM_173211 NM_174886 NM_001374396 NM_001374397	NM_001164074 NM_001164075 NM_001164076 NM_001164077 NM_009372
RefSeq (білок)	NP_001265611 NP_001265613 NP_001265615 NP_003235 NP_733796 NP_775299 NP_775300 NP_775301 NP_775302 NP_775303 NP_777480 NP_001361325 NP_001361326	NP_001157546 NP_001157547 NP_001157548 NP_001157549 NP_033398
Локус (UCSC)	Хр. 18: 3.41 – 3.46 Mb	Хр. 17: 71.15 – 71.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TGIF1 (англ. TGFB induced factor homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 401 амінокислот, а молекулярна маса — 43 013.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVLAQSRVSA		GVGSPHCSGS		GGGGSDSFPW		PASHPGNPQC		SFSTAFLASP
RLSRGTLAYL		PPAPWSSLAT		PSALLGSSCA		PPPPPARCPQ		PRALSPELGT
KAGPRRPHRW		ELPRSPSQGA		QGPAPRRRLL		ETMKGIVAAS		GSETEDEDSM
DIPLDLSSSA		GSGKRRRRGN		LPKESVQILR		DWLYEHRYNA		YPSEQEKALL
SQQTHLSTLQ		VCNWFINARR		RLLPDMLRKD		GKDPNQFTIS		RRGAKISETS
SVESVMGIKN		FMPALEETPF		HSCTAGPNPT		LGRPLSPKPS		SPGSVLARPS
VICHTTVTAL		KDVPFSLCQS		VGVGQNTDIQ		QIAAKNFTDT		SLMYPEDTCK
SGPSTNTQSG		LFNTPPPTPP		DLNQDFSGFQ		LLVDVALKRA		AEMELQAKLT
A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Bertolino E., Reimund B., Wildt-Perinic D., Clerc R.G. (1995). A novel homeobox protein which recognizes a TGT core and functionally interferes with a retinoid-responsive motif. J. Biol. Chem. 270: 31178—31188. PMID 8537382 DOI:10.1074/jbc.270.52.31178
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 18