TGIF2

TGIF2
Ідентифікатори
Символи	TGIF2, TGFB induced factor homeobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607294 MGI: 1915299 HomoloGene: 32514 GeneCards: TGIF2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • retina development in camera-type eye • regulation of gastrulation • positive regulation of neuron differentiation • nodal signaling pathway • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	60436	228839
Ensembl	ENSG00000118707	ENSMUSG00000062175
UniProt	Q9GZN2	Q8C0Y1
RefSeq (мРНК)	NM_021809 NM_001199513 NM_001199514 NM_001199515	NM_001291124 NM_173396
RefSeq (білок)	NP_001186442 NP_001186443 NP_001186444 NP_068581	NP_001278053 NP_775572
Локус (UCSC)	Хр. 20: 36.57 – 36.59 Mb	Хр. 2: 156.68 – 156.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TGIF2 (англ. TGFB induced factor homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 237 амінокислот, а молекулярна маса — 25 878.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDSDLGEDE		GLLSLAGKRK		RRGNLPKESV		KILRDWLYLH		RYNAYPSEQE
KLSLSGQTNL		SVLQICNWFI		NARRRLLPDM		LRKDGKDPNQ		FTISRRGGKA
SDVALPRGSS		PSVLAVSVPA		PTNVLSLSVC		SMPLHSGQGE		KPAAPFPRGE
LESPKPLVTP		GSTLTLLTRA		EAGSPTGGLF		NTPPPTPPEQ		DKEDFSSFQL
LVEVALQRAA		EMELQKQQDP		SLPLLHTPIP		LVSENPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Melhuish T.A., Gallo C.M., Wotton D. (2001). TGIF2 interacts with histone deacetylase 1 and represses transcription. J. Biol. Chem. 276: 32109—32114. PMID 11427533 DOI:10.1074/jbc.M103377200

Див. також

• Хромосома 20