THAP11

THAP11
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LAU, 5AJS
Ідентифікатори
Символи	THAP11, CTG-B43a, CTG-B45d, RONIN, HRIHFB2206, THAP domain containing 11
Зовнішні ІД	OMIM: 609119 MGI: 1930964 HomoloGene: 10726 GeneCards: THAP11
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • intercellular bridge • цитоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57215	59016
Ensembl	ENSG00000168286	ENSMUSG00000036442
UniProt	Q96EK4	Q9JJD0
RefSeq (мРНК)	NM_020457	NM_021513
RefSeq (білок)	NP_065190	NP_067488
Локус (UCSC)	Хр. 16: 67.84 – 67.84 Mb	Хр. 8: 106.58 – 106.58 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

THAP11 (англ. THAP domain containing 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 314 амінокислот, а молекулярна маса — 34 455.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPGFTCCVPG		CYNNSHRDKA		LHFYTFPKDA		ELRRLWLKNV		SRAGVSGCFS
TFQPTTGHRL		CSVHFQGGRK		TYTVRVPTIF		PLRGVNERKV		ARRPAGAAAA
RRRQQQQQQQ		QQQQQQQQQQ		QQQQQQQQQQ		QQSSPSASTA		QTAQLQPNLV
SASAAVLLTL		QATVDSSQAP		GSVQPAPITP		TGEDVKPIDL		TVQVEFAAAE
GAAAAAAASE		LQAATAGLEA		AECPMGPQLV		VVGEEGFPDT		GSDHSYSLSS
GTTEEELLRK		LNEQRDILAL		MEVKMKEMKG		SIRHLRLTEA		KLREELREKD
RLLAMAVIRK		KHGM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pandey N., Mittal U., Srivastava A.K., Mukerji M. (2004). SMARCA2 and THAP11: potential candidates for polyglutamine disorders as evidenced from polymorphism and protein-folding simulation studies. J. Hum. Genet. 49: 596—602. PMID 15368101 DOI:10.1007/s10038-004-0194-8
• Gervais V., Campagne S., Durand J., Muller I., Milon A. (2013). NMR studies of a new family of DNA binding proteins: the THAP proteins. J. Biomol. NMR. 56: 3—15. PMID 23306615 DOI:10.1007/s10858-012-9699-1

Див. також

• Хромосома 16