TIMELESS

TIMELESS
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4XHT, 4XHU, 4XHW
Ідентифікатори
Символи	TIMELESS, TIM, TIM1, hTIM, timeless circadian clock, timeless circadian regulator
Зовнішні ІД	OMIM: 603887 MGI: 1321393 HomoloGene: 31206 GeneCards: TIMELESS
Пов'язані генетичні захворювання
натуральна віспа
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • DNA binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • nuclear chromosome • replication fork protection complex • site of double-strand break • хромосома Біологічний процес • cell cycle phase transition • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • lung development • ритмічний процес • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • поділ клітини • morphogenesis of an epithelium • multicellular organism development • regulation of cell population proliferation • regulation of circadian rhythm • циркадний ритм • клітинний цикл • detection of abiotic stimulus • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • branching morphogenesis of an epithelial tube • cellular response to DNA damage stimulus • cellular response to hydroxyurea • cellular response to cisplatin • cellular response to bleomycin • positive regulation of double-strand break repair • DNA replication checkpoint signaling • GO:0100026 Репарація ДНК • replication fork arrest • replication fork protection • positive regulation of double-strand break repair via homologous recombination • реплікація ДНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8914	21853
Ensembl	ENSG00000111602	ENSMUSG00000039994
UniProt	Q9UNS1	Q9R1X4
RefSeq (мРНК)	NM_003920 NM_001330295	NM_001136082 NM_001164080 NM_001164081 NM_011589
RefSeq (білок)	NP_001317224 NP_003911	NP_001129554 NP_001157552 NP_001157553 NP_035719
Локус (UCSC)	Хр. 12: 56.42 – 56.45 Mb	Хр. 10: 128.07 – 128.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TIMELESS (англ. Timeless circadian clock) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 208 амінокислот, а молекулярна маса — 138 658.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLHMMNCEL		LATCSALGYL		EGDTYHKEPD		CLESVKDLIR		YLRHEDETRD
VRQQLGAAQI		LQSDLLPILT		QHHQDKPLFD		AVIRLMVNLT		QPALLCFGNL
PKEPSFRHHF		LQVLTYLQAY		KEAFASEKAF		GVLSETLYEL		LQLGWEERQE
EDNLLIERIL		LLVRNILHVP		ADLDQEKKID		DDASAHDQLL		WAIHLSGLDD
LLLFLASSSA		EEQWSLHVLE		IVSLMFRDQN		PEQLAGVGQG		RLAQERSADF
AELEVLRQRE		MAEKKTRALQ		RGNRHSRFGG		SYIVQGLKSI		GERDLIFHKG
LHNLRNYSSD		LGKQPKKVPK		RRQAARELSI		QRRSALNVRL		FLRDFCSEFL
ENCYNRLMGS		VKDHLLREKA		QQHDETYYMW		ALAFFMAFNR		AASFRPGLVS
ETLSVRTFHF		IEQNLTNYYE		MMLTDRKEAA		SWARRMHLAL		KAYQELLATV
NEMDISPDEA		VRESSRIIKN		NIFYVMEYRE		LFLALFRKFD		ERCQPRSFLR
DLVETTHLFL		KMLERFCRSR		GNLVVQNKQK		KRRKKKKKVL		DQAIVSGNVP
SSPEEVEAVW		PALAEQLQCC		AQNSELSMDS		VVPFDAASEV		PVEEQRAEAM
VRIQDCLLAG		QAPQALTLLR		SAREVWPEGD		VFGSQDISPE		EEIQLLKQIL
SAPLPRQQGP		EERGAEEEEE		EEEEEEEELQ		VVQVSEKEFN		FLDYLKRFAC
STVVRAYVLL		LRSYQQNSAH		TNHCIVKMLH		RLAHDLKMEA		LLFQLSVFCL
FNRLLSDPAA		GAYKELVTFA		KYILGKFFAL		AAVNQKAFVE		LLFWKNTAVV
REMTEGYGSL		DDRSSSRRAP		TWSPEEEAHL		RELYLANKDV		EGQDVVEAIL
AHLNTVPRTR		KQIIHHLVQM		GLADSVKDFQ		RKGTHIVLWT		GDQELELQRL
FEEFRDSDDV		LGHIMKNITA		KRSRARIVDK		LLALGLVAER		RELYKKRQKK
LASSILPNGA		ESLKDFCQED		LEEEENLPEE		DSEEEEEGGS		EAEQVQGSLV
LSNENLGQSL		HQEGFSIPLL		WLQNCLIRAA		DDREEDGCSQ		AVPLVPLTEE
NEEAMENEQF		QQLLRKLGVR		PPASGQETFW		RIPAKLSPTQ		LRRAAASLSQ
PEEEQKLQPE		LQPKVPGEQG		SDEEHCKEHR		AQALRALLLA		HKKKAGLASP
EEEDAVGKEP		LKAAPKKRQL		LDSDEEQEED		EGRNRAPELG		APGIQKKKRY
QIEDDEDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, мітоз, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Uensal-Kacmaz K., Mullen T.E., Kaufmann W.K., Sancar A. (2005). Coupling of human circadian and cell cycles by the timeless protein. Mol. Cell. Biol. 25: 3109—3116. PMID 15798197 DOI:10.1128/MCB.25.8.3109-3116.2005
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Chou D.M., Elledge S.J. (2006). Tipin and Timeless form a mutually protective complex required for genotoxic stress resistance and checkpoint function. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 18143—18147. PMID 17116885 DOI:10.1073/pnas.0609251103
• Yoshizawa-Sugata N., Masai H. (2007). Human Tim/Timeless-interacting protein, Tipin, is required for efficient progression of S phase and DNA replication checkpoint. J. Biol. Chem. 282: 2729—2740. PMID 17102137 DOI:10.1074/jbc.M605596200
• Gotter A.L., Suppa C., Emanuel B.S. (2007). Mammalian TIMELESS and Tipin are evolutionarily conserved replication fork-associated factors. J. Mol. Biol. 366: 36—52. PMID 17141802 DOI:10.1016/j.jmb.2006.10.097

Див. також

• Хромосома 12