TMEM173

TMEM173
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4EF4, 4EF5, 4EMT, 4EMU, 4F5D, 4F5E, 4F5W, 4F5Y, 4F9E, 4F9G, 4KSY, 4LOH, 4LOI, 4QXO, 4QXP, 4QXQ, 4QXR, 5BQX, 5JEJ
Ідентифікатори
Символи	STING1, ERIS, MITA, MPYS, NET23, SAVI, STING, hMITA, hSTING, Stimulator of interferon genes, transmembrane protein 173, STING-beta, TMEM173, stimulator of interferon response cGAMP interactor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 612374 MGI: 1919762 HomoloGene: 18868 GeneCards: STING1
Пов'язані генетичні захворювання
STING-associated vasculopathy with onset in infancy
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • cyclic-di-GMP binding • protein homodimerization activity • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • protein kinase binding • ubiquitin protein ligase binding • 2',3'-cyclic GMP-AMP binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • пероксисома • мітохондріальна зовнішня мембрана • мітохондрія • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • cytoplasmic vesicle membrane • клітинна мембрана • secretory granule membrane Біологічний процес • interferon-beta production • cellular response to interferon-beta • процес імунної системи • regulation of type I interferon production • defense response to virus • cellular response to exogenous dsRNA • activation of innate immune response • positive regulation of protein binding • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of defense response to virus by host • GO:0097285 апоптоз • вроджений імунітет • neutrophil degranulation • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • GO:0022415 viral process • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of type I interferon production • регуляція експресії генів • regulation of cellular metabolic process • regulation of inflammatory response • cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway in response to virus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	340061	72512
Ensembl	ENSG00000184584 ENSG00000288243	ENSMUSG00000024349
UniProt	Q86WV6	Q3TBT3
RefSeq (мРНК)	NM_001301738 NM_198282 NM_001367258	NM_001289591 NM_001289592 NM_028261
RefSeq (білок)	NP_001288667 NP_938023 NP_001354187	NP_001276520 NP_001276521 NP_082537
Локус (UCSC)	Хр. 5: 139.48 – 139.48 Mb	Хр. 18: 35.87 – 35.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TMEM173 (англ. Transmembrane protein 173) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 379 амінокислот, а молекулярна маса — 42 193.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPHSSLHPSI		PCPRGHGAQK		AALVLLSACL		VTLWGLGEPP		EHTLRYLVLH
LASLQLGLLL		NGVCSLAEEL		RHIHSRYRGS		YWRTVRACLG		CPLRRGALLL
LSIYFYYSLP		NAVGPPFTWM		LALLGLSQAL		NILLGLKGLA		PAEISAVCEK
GNFNVAHGLA		WSYYIGYLRL		ILPELQARIR		TYNQHYNNLL		RGAVSQRLYI
LLPLDCGVPD		NLSMADPNIR		FLDKLPQQTG		DHAGIKDRVY		SNSIYELLEN
GQRAGTCVLE		YATPLQTLFA		MSQYSQAGFS		REDRLEQAKL		FCRTLEDILA
DAPESQNNCR		LIAYQEPADD		SSFSLSQEVL		RHLRQEEKEE		VTVGSLKTSA
VPSTSTMSQE		PELLISGMEK		PLPLRTDFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі, зовнішній мембрані мітохондрій.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ishikawa H., Barber G.N. (2008). STING is an endoplasmic reticulum adaptor that facilitates innate immune signalling. Nature. 455: 674—678. PMID 18724357 DOI:10.1038/nature07317
• Ishikawa H., Ma Z., Barber G.N. (2009). STING regulates intracellular DNA-mediated, type I interferon-dependent innate immunity. Nature. 461: 788—792. PMID 19776740 DOI:10.1038/nature08476
• Orzalli M.H., DeLuca N.A., Knipe D.M. (2012). Nuclear IFI16 induction of IRF-3 signaling during herpesviral infection and degradation of IFI16 by the viral ICP0 protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109: E3008—E3017. PMID 23027953 DOI:10.1073/pnas.1211302109
• Shu C., Yi G., Watts T., Kao C.C., Li P. (2012). Structure of STING bound to cyclic di-GMP reveals the mechanism of cyclic dinucleotide recognition by the immune system. Nat. Struct. Mol. Biol. 19: 722—724. PMID 22728658 DOI:10.1038/nsmb.2331
• Huang Y.H., Liu X.Y., Du X.X., Jiang Z.F., Su X.D. (2012). The structural basis for the sensing and binding of cyclic di-GMP by STING. Nat. Struct. Mol. Biol. 19: 728—730. PMID 22728659 DOI:10.1038/nsmb.2333

Див. також

• Хромосома 5