TNPO1

TNPO1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1QBK, 2H4M, 2OT8, 2QMR, 2Z5J, 2Z5K, 2Z5M, 2Z5N, 2Z5O, 4FDD, 4FQ3, 4JLQ, 4OO6
Ідентифікатори
Символи	TNPO1, IPO2, KPNB2, MIP, MIP1, TRN, Transportin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602901 MGI: 2681523 HomoloGene: 5358 GeneCards: TNPO1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nuclear localization sequence binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • Ядерна мембрана; • nuclear periphery; • екзосома; • клітинне ядро; • війка;
Біологічний процес	• ribosomal protein import into nucleus; • regulation of mRNA stability; • protein transport; • GO:0022415 viral process; • intracellular protein transport; • NLS-bearing protein import into nucleus; • intraciliary transport involved in cilium assembly; • GO:0015915 транспорт; • protein import into nucleus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	3842
	238799
	ENSG00000083312
	ENSMUSG00000009470
	Q92973
	Q8BFY9
	NM_002270; NM_153188
	NM_001048267; NM_178716
NP_002261; NP_694858; NP_001351221; NP_001351222; NP_001351223;
	NP_001351224; NP_001351225
	NP_001041732; NP_848831
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TNPO1 (англ. Transportin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 898 амінокислот, а молекулярна маса — 102 355^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVWDRQTKME	YEWKPDEQGL	QQILQLLKES	QSPDTTIQRT	VQQKLEQLNQ
YPDFNNYLIF	VLTKLKSEDE	PTRSLSGLIL	KNNVKAHFQN	FPNGVTDFIK
SECLNNIGDS	SPLIRATVGI	LITTIASKGE	LQNWPDLLPK	LCSLLDSEDY
NTCEGAFGAL	QKICEDSAEI	LDSDVLDRPL	NIMIPKFLQF	FKHSSPKIRS
HAVACVNQFI	ISRTQALMLH	IDSFIENLFA	LAGDEEPEVR	KNVCRALVML
LEVRMDRLLP	HMHNIVEYML	QRTQDQDENV	ALEACEFWLT	LAEQPICKDV
LVRHLPKLIP	VLVNGMKYSD	IDIILLKGDV	EEDETIPDSE	QDIRPRFHRS
RTVAQQHDED	GIEEEDDDDD	EIDDDDTISD	WNLRKCSAAA	LDVLANVYRD
ELLPHILPLL	KELLFHHEWV	VKESGILVLG	AIAEGCMQGM	IPYLPELIPH
LIQCLSDKKA	LVRSITCWTL	SRYAHWVVSQ	PPDTYLKPLM	TELLKRILDS
NKRVQEAACS	AFATLEEEAC	TELVPYLAYI	LDTLVFAFSK	YQHKNLLILY
DAIGTLADSV	GHHLNKPEYI	QMLMPPLIQK	WNMLKDEDKD	LFPLLECLSS
VATALQSGFL	PYCEPVYQRC	VNLVQKTLAQ	AMLNNAQPDQ	YEAPDKDFMI
VALDLLSGLA	EGLGGNIEQL	VARSNILTLM	YQCMQDKMPE	VRQSSFALLG
DLTKACFQHV	KPCIADFMPI	LGTNLNPEFI	SVCNNATWAI	GEISIQMGIE
MQPYIPMVLH	QLVEIINRPN	TPKTLLENTA	ITIGRLGYVC	PQEVAPMLQQ
FIRPWCTSLR	NIRDNEEKDS	AFRGICTMIS	VNPSGVIQDF	IFFCDAVASW
INPKDDLRDM	FCKILHGFKN	QVGDENWRRF	SDQFPLPLKE	RLAAFYGV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Bonifaci N., Moroianu J., Radu A., Blobel G. (1997). Karyopherin beta2 mediates nuclear import of a mRNA binding protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 5055—5060. PMID 9144189 DOI:10.1073/pnas.94.10.5055
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Doi A., Shiosaka T., Takaoka Y., Yanagisawa K., Fujita S. (1998). Molecular cloning of the cDNA encoding A + U-rich element RNA binding factor. Biochim. Biophys. Acta. 1396: 51—56. PMID 9524220 DOI:10.1016/S0167-4781(97)00223-6
Jaekel S., Goerlich D. (1998). Importin beta, transportin, RanBP5 and RanBP7 mediate nuclear import of ribosomal proteins in mammalian cells. EMBO J. 17: 4491—4502. PMID 9687515 DOI:10.1093/emboj/17.15.4491
Arnold M., Nath A., Hauber J., Kehlenbach R.H. (2006). Multiple importins function as nuclear transport receptors for the Rev protein of human immunodeficiency virus type 1. J. Biol. Chem. 281: 20883—20890. PMID 16704975 DOI:10.1074/jbc.M602189200
Mingot J.M., Vega S., Maestro B., Sanz J.M., Nieto M.A. (2009). Characterization of Snail nuclear import pathways as representatives of C2H2 zinc finger transcription factors. J. Cell Sci. 122: 1452—1460. PMID 19386897 DOI:10.1242/jcs.041749