TRAPPC2

TRAPPC2
Ідентифікатори
Символи	TRAPPC2, MIP2A, SEDL, SEDT, TRAPPC2P1, TRS20, ZNF547L, hYP38334, trafficking protein particle complex 2, trafficking protein particle complex subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 300202 MGI: 1913476 HomoloGene: 5436 GeneCards: TRAPPC2
Пов'язані генетичні захворювання
spondyloepiphyseal dysplasia tarda
Онтологія гена Молекулярна функція • transmembrane transporter binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • внутрішньоклітинний • perinuclear region of cytoplasm • Golgi membrane • клітинне ядро • нуклеоплазма • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • внутрішньоклітинна мембранна органела • TRAPP complex Біологічний процес • skeletal system development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • COPII vesicle coating • vesicle-mediated transport • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6399	66226
Ensembl	ENSG00000196459	ENSMUSG00000079317
UniProt	P0DI81 P0DI82	Q9CQP2
RefSeq (мРНК)	NM_001011658 NM_001128835 NM_014563	NM_025432 NM_001313722
RefSeq (білок)	NP_001011658 NP_001122307 NP_055378 NP_001011658.1 NP_055378.1	NP_001300651 NP_079708 NP_079595
Локус (UCSC)	н/д	Хр. X: 165.22 – 165.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRAPPC2 (англ. Trafficking protein particle complex 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі X-хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 140 амінокислот, а молекулярна маса — 16 445.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGSFYFVIV		GHHDNPVFEM		EFLPAGKAES		KDDHRHLNQF		IAHAALDLVD
ENMWLSNNMY		LKTVDKFNEW		FVSAFVTAGH		MRFIMLHDIR		QEDGIKNFFT
DVYDLYIKFS		MNPFYEPNSP		IRSSAFDRKV		QFLGKKHLLS

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, транспорт, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gecz J., Shaw M.A., Bellon J.R., de Barros Lopes M. (2003). Human wild-type SEDL protein functionally complements yeast Trs20p but some naturally occurring SEDL mutants do not. Gene. 320: 137—144. PMID 14597397 DOI:10.1016/S0378-1119(03)00819-9

Див. також

• Хромосома X