TRERF1

TRERF1
Ідентифікатори
Символи	TRERF1, BCAR2, HSA277276, RAPA, TREP132, TReP-132, dJ139D8.5, transcriptional regulating factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610322 MGI: 2442086 HomoloGene: 14129 GeneCards: TRERF1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001104 transcription coregulator activity • DNA binding • DNA binding, bending • nuclear receptor coactivator activity • transcription factor binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • histone deacetylase complex • transcription regulator complex • нуклеоплазма • ядерце • гіалоплазма Біологічний процес • multicellular organism development • cholesterol catabolic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • homeostatic process • steroid biosynthetic process • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • regulation of hormone biosynthetic process • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55809	224829
Ensembl	ENSG00000124496	ENSMUSG00000064043
UniProt	Q96PN7	Q8BXJ2
RefSeq (мРНК)	NM_001297573 NM_018415 NM_033501 NM_033502 NM_001391983 NM_001391984 NM_001395490	NM_001097623 NM_172622
RefSeq (білок)	NP_001284502 NP_277037	NP_001091092 NP_766210
Локус (UCSC)	Хр. 6: 42.22 – 42.45 Mb	Хр. 17: 47.45 – 47.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRERF1 (англ. Transcriptional regulating factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 200 амінокислот, а молекулярна маса — 132 256.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDQQLYKTN		HVAHGSENLF		YQQPPLGVHS		GLNHNYGNAV		TGGGMDAPQA
SPISPHFPQD		TRDGLGLPVG		SKNLGQMDTS		RQGGWGSHAG		PGNHVQLRGN
LANSNMMWGA		PAQAEPTDGY		QYTYSQASEI		RTQKLTSGVL		HKLDSFTQVF
ANQNLRIQVN		NMAQVLHTQS		AVMDGAPDSA		LRQLLSQKPM		EPPAPAIPSR
YQQVPQQPHP		GFTGGLSKPA		LQVGQHPTQG		HLYYDYQQPL		AQVPVQGGQP
LQAPQMLSQH		MQQMQQHQYY		PPQQQQQAGQ		QRISMQEIQT		QPQQIRPSQP
QPPPQQQQPQ		QLQLQQRQGS		MQIPQYYQPQ		PMMQHLQEQQ		QQQMHLQPPS
YHRDPHQYTP		EQAHTVQLIP		LGSMSQYYYQ		EPQQPYSHPL		YQQSHLSQHQ
QREDSQLKTY		SSDRQAQAML		SSHGDLGPPD		TGMGDPASSD		LTRVSSTLPH
RPLLSPSGIH		LNNMGPQHQQ		LSPSAMWPQM		HLPDGRAQPG		SPESSGQPKG
AFGEQFDAKN		KLTCSICLKE		FKNLPALNGH		MRSHGGMRAS		PNLKQEEGEK
VLPPQPQPPL		PPPPPPPPPP		QLPPEAESLT		PMVMPVSVPV		KLLPPKPSSQ
GFTNSTVAAP		SARDKPASSM		SDDEMPVLEI		PRKHQPSVPK		AEEPLKTVQE
KKKFRHRPEP		LFIPPPPSYN		PNPAASYSGA		TLYQSQLRSP		RVLGDHLLLD
PTHELPPYTP		PPMLSPVRQG		SGLFSNVLIS		GHGPGAHPQL		PLTPLTPTPR
VLLCRSNSID		GSNVTVTPGP		GEQTVDVEPR		INIGLRFQAE		IPELQDISAL
AQDTHKATLV		WKPWPELENH		DLQQRVENLL		NLCCSSALPG		GGTNSEFALH
SLFEAKGDVM		VALEMLLLRK		PVRLKCHPLA		NYHYAGSDKW		TSLERKLFNK
ALATYSKDFI		FVQKMVKSKT		VAQCVEYYYT		WKKIMRLGRK		HRTRLAEIID
DCVTSEEEEE		LEEEEEEDPE		EDRKSTKEEE		SEVPKSPEPP		PVPVLAPTEG
PPLQALGQPS		GSFICEMPNC		GAVFSSRQAL		NGHARIHGGT		NQVTKARGAI
PSGKQKPGGT		QSGYCSVKSS		PSHSTTSGET		DPTTIFPCKE		CGKVFFKIKS
RNAHMKTHRQ		QEEQQRQKAQ		KAAFAAEMAA		TIERTTGPVG		APGLLPLDQL
SLIKPIKDVD		ILDDDVVQQL		GGVMEEAEVV		DTDLLLDDQD		SVLLQGDAEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Gizard F., Lavallee B., DeWitte F., Hum D.W. (2001). A novel zinc finger protein TReP-132 interacts with CBP/p300 to regulate human CYP11A1 gene expression. J. Biol. Chem. 276: 33881—33892. PMID 11349124 DOI:10.1074/jbc.M100113200

Див. також

• Хромосома 6