TRIM24

TRIM24
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YYN, 3O33, 3O34, 3O35, 3O36, 3O37, 4YAB, 4YAD, 4YAT, 4YAX, 4YBM, 4YBS, 4YBT, 4YC9, 4ZQL
Ідентифікатори
Символи	TRIM24, PTC6, RNF82, TF1A, TIF1, TIF1A, TIF1ALPHA, hTIF1, tripartite motif containing 24
Зовнішні ІД	OMIM: 603406 MGI: 109275 HomoloGene: 20830 GeneCards: TRIM24
Онтологія гена Молекулярна функція • protein kinase activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • zinc ion binding • p53 binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • methylated histone binding • estrogen response element binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear receptor binding • lysine-acetylated histone binding • signaling receptor binding • protein tyrosine kinase activity • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • внутрішньоклітинний • perichromatin fibrils • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • regulation of apoptotic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of protein stability • calcium ion homeostasis • regulation of signal transduction by p53 class mediator • regulation of vitamin D receptor signaling pathway • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • cellular response to estrogen stimulus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • protein phosphorylation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • GO:0044257 protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • protein autophosphorylation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cell population proliferation • peptidyl-tyrosine phosphorylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8805	21848
Ensembl	ENSG00000122779	ENSMUSG00000029833
UniProt	O15164	Q64127
RefSeq (мРНК)	NM_003852 NM_015905	NM_001272064 NM_001272076 NM_145076
RefSeq (білок)	NP_003843 NP_056989	NP_001258993 NP_001259005 NP_659542
Локус (UCSC)	Хр. 7: 138.46 – 138.59 Mb	Хр. 6: 37.85 – 37.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM24 (англ. Tripartite motif containing 24) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 050 амінокислот, а молекулярна маса — 116 831.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEVAVEKAVA		AAAAASAAAS		GGPSAAPSGE		NEAESRQGPD		SERGGEAARL
NLLDTCAVCH		QNIQSRAPKL		LPCLHSFCQR		CLPAPQRYLM		LPAPMLGSAE
TPPPVPAPGS		PVSGSSPFAT		QVGVIRCPVC		SQECAERHII		DNFFVKDTTE
VPSSTVEKSN		QVCTSCEDNA		EANGFCVECV		EWLCKTCIRA		HQRVKFTKDH
TVRQKEEVSP		EAVGVTSQRP		VFCPFHKKEQ		LKLYCETCDK		LTCRDCQLLE
HKEHRYQFIE		EAFQNQKVII		DTLITKLMEK		TKYIKFTGNQ		IQNRIIEVNQ
NQKQVEQDIK		VAIFTLMVEI		NKKGKALLHQ		LESLAKDHRM		KLMQQQQEVA
GLSKQLEHVM		HFSKWAVSSG		SSTALLYSKR		LITYRLRHLL		RARCDASPVT
NNTIQFHCDP		SFWAQNIINL		GSLVIEDKES		QPQMPKQNPV		VEQNSQPPSG
LSSNQLSKFP		TQISLAQLRL		QHMQQQVMAQ		RQQVQRRPAP		VGLPNPRMQG
PIQQPSISHQ		QPPPRLINFQ		NHSPKPNGPV		LPPHPQQLRY		PPNQNIPRQA
IKPNPLQMAF		LAQQAIKQWQ		ISSGQGTPST		TNSTSSTPSS		PTITSAAGYD
GKAFGSPMID		LSSPVGGSYN		LPSLPDIDCS		STIMLDNIVR		KDTNIDHGQP
RPPSNRTVQS		PNSSVPSPGL		AGPVTMTSVH		PPIRSPSASS		VGSRGSSGSS
SKPAGADSTH		KVPVVMLEPI		RIKQENSGPP		ENYDFPVVIV		KQESDEESRP
QNANYPRSIL		TSLLLNSSQS		STSEETVLRS		DAPDSTGDQP		GLHQDNSSNG
KSEWLDPSQK		SPLHVGETRK		EDDPNEDWCA		VCQNGGELLC		CEKCPKVFHL
SCHVPTLTNF		PSGEWICTFC		RDLSKPEVEY		DCDAPSHNSE		KKKTEGLVKL
TPIDKRKCER		LLLFLYCHEM		SLAFQDPVPL		TVPDYYKIIK		NPMDLSTIKK
RLQEDYSMYS		KPEDFVADFR		LIFQNCAEFN		EPDSEVANAG		IKLENYFEEL
LKNLYPEKRF		PKPEFRNESE		DNKFSDDSDD		DFVQPRKKRL		KSIEERQLLK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Thenot S., Henriquet C., Rochefort H., Cavailles V. (1997). Differential interaction of nuclear receptors with the putative human transcriptional coactivator hTIF1. J. Biol. Chem. 272: 12062—12068. PMID 9115274 DOI:10.1074/jbc.272.18.12062
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Klugbauer S., Rabes H.M. (1999). The transcription coactivator HTIF1 and a related protein are fused to the RET receptor tyrosine kinase in childhood papillary thyroid carcinomas. Oncogene. 18: 4388—4393. PMID 10439047 DOI:10.1038/sj.onc.1202824
• Teyssier C., Ou C.Y., Khetchoumian K., Losson R., Stallcup M.R. (2006). Transcriptional intermediary factor 1alpha mediates physical interaction and functional synergy between the coactivator-associated arginine methyltransferase 1 and glucocorticoid receptor-interacting protein 1 nuclear receptor coactivators. Mol. Endocrinol. 20: 1276—1286. PMID 16322096 DOI:10.1210/me.2005-0393
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 7