TRIM25

TRIM25
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4CFG, 4LTB, 5FER
Ідентифікатори
Символи	TRIM25, EFP, RNF147, Z147, ZNF147, tripartite motif containing 25
Зовнішні ІД	OMIM: 600453 MGI: 102749 HomoloGene: 48325 GeneCards: TRIM25
шифр КФ	2.3.2.27
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • RNA binding • cadherin binding • zinc ion binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма • ядерні тільця • внутрішньоклітинний Біологічний процес • ERAD pathway • negative regulation of viral entry into host cell • процес імунної системи • interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • protein monoubiquitination • defense response to virus • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • translesion synthesis • negative regulation of type I interferon production • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • response to estrogen • response to vitamin D • protein deubiquitination • ubiquitin-dependent ERAD pathway • cellular response to leukemia inhibitory factor • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of viral entry into host cell Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7706	217069
Ensembl	ENSG00000121060	ENSMUSG00000000275
UniProt	Q14258	Q61510
RefSeq (мРНК)	NM_005082	NM_009546
RefSeq (білок)	NP_005073	NP_033572
Локус (UCSC)	Хр. 17: 56.84 – 56.91 Mb	Хр. 11: 88.89 – 88.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM25 (англ. Tripartite motif containing 25) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 630 амінокислот, а молекулярна маса — 70 973.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAELCPLAEE		LSCSICLEPF		KEPVTTPCGH		NFCGSCLNET		WAVQGSPYLC
PQCRAVYQAR		PQLHKNTVLC		NVVEQFLQAD		LAREPPADVW		TPPARASAPS
PNAQVACDHC		LKEAAVKTCL		VCMASFCQEH		LQPHFDSPAF		QDHPLQPPVR
DLLRRKCSQH		NRLREFFCPE		HSECICHICL		VEHKTCSPAS		LSQASADLEA
TLRHKLTVMY		SQINGASRAL		DDVRNRQQDV		RMTANRKVEQ		LQQEYTEMKA
LLDASETTST		RKIKEEEKRV		NSKFDTIYQI		LLKKKSEIQT		LKEEIEQSLT
KRDEFEFLEK		ASKLRGISTK		PVYIPEVELN		HKLIKGIHQS		TIDLKNELKQ
CIGRLQEPTP		SSGDPGEHDP		ASTHKSTRPV		KKVSKEEKKS		KKPPPVPALP
SKLPTFGAPE		QLVDLKQAGL		EAAAKATSSH		PNSTSLKAKV		LETFLAKSRP
ELLEYYIKVI		LDYNTAHNKV		ALSECYTVAS		VAEMPQNYRP		HPQRFTYCSQ
VLGLHCYKKG		IHYWEVELQK		NNFCGVGICY		GSMNRQGPES		RLGRNSASWC
VEWFNTKISA		WHNNVEKTLP		STKATRVGVL		LNCDHGFVIF		FAVADKVHLM
YKFRVDFTEA		LYPAFWVFSA		GATLSICSPK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, лігаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, противірусний захист, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zou W., Zhang D.-E. (2006). The interferon-inducible ubiquitin-protein isopeptide ligase (E3) EFP also functions as an ISG15 E3 ligase. J. Biol. Chem. 281: 3989—3994. PMID 16352599 DOI:10.1074/jbc.M510787200
• Zou W., Wang J., Zhang D.-E. (2007). Negative regulation of ISG15 E3 ligase EFP through its autoISGylation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 354: 321—327. PMID 17222803 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.12.210

Див. також

• Хромосома 17