TRIM27

TRIM27
Ідентифікатори
Символи	TRIM27, RFP, RNF76, tripartite motif containing 27
Зовнішні ІД	OMIM: 602165 MGI: 97904 HomoloGene: 111010 GeneCards: TRIM27
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • identical protein binding • transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • SUMO transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • ендосома • PML body • Ядерна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • retromer complex • early endosome • клітинне ядро • fibrillar center • ядерце • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of adaptive immune response • negative regulation of protein kinase activity • protein K63-linked ubiquitination • protein trimerization • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • transcription, DNA-templated • negative regulation of calcium ion import • negative regulation of gene expression, epigenetic • retrograde transport, endosome to Golgi • Сперматогенез • Arp2/3 complex-mediated actin nucleation • negative regulation of tumor necrosis factor production • проліферація • peptidyl-tyrosine phosphorylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of viral transcription • вроджений імунітет • positive regulation of actin nucleation • protein sumoylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5987	19720
Ensembl	ENSG00000229006 ENSG00000233948 ENSG00000204713 ENSG00000215641 ENSG00000237071 ENSG00000237462 ENSG00000234495	ENSMUSG00000021326
UniProt	P14373	Q62158
RefSeq (мРНК)	NM_030950 NM_006510	NM_009054
RefSeq (білок)	NP_006501	NP_033080
Локус (UCSC)	Хр. 6: 28.9 – 28.92 Mb	Хр. 13: 21.36 – 21.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM27 (англ. Tripartite motif containing 27) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 513 амінокислот, а молекулярна маса — 58 490.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASGSVAECL		QQETTCPVCL		QYFAEPMMLD		CGHNICCACL		ARCWGTAETN
VSCPQCRETF		PQRHMRPNRH		LANVTQLVKQ		LRTERPSGPG		GEMGVCEKHR
EPLKLYCEED		QMPICVVCDR		SREHRGHSVL		PLEEAVEGFK		EQIQNQLDHL
KRVKDLKKRR		RAQGEQARAE		LLSLTQMERE		KIVWEFEQLY		HSLKEHEYRL
LARLEELDLA		IYNSINGAIT		QFSCNISHLS		SLIAQLEEKQ		QQPTRELLQD
IGDTLSRAER		IRIPEPWITP		PDLQEKIHIF		AQKCLFLTES		LKQFTEKMQS
DMEKIQELRE		AQLYSVDVTL		DPDTAYPSLI		LSDNLRQVRY		SYLQQDLPDN
PERFNLFPCV		LGSPCFIAGR		HYWEVEVGDK		AKWTIGVCED		SVCRKGGVTS
APQNGFWAVS		LWYGKEYWAL		TSPMTALPLR		TPLQRVGIFL		DYDAGEVSFY
NVTERCHTFT		FSHATFCGPV		RPYFSLSYSG		GKSAAPLIIC		PMSGIDGFSG
HVGNHGHSME		TSP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендосомах.

Література

• Takahashi M., Inaguma Y., Hiai H., Hirose F. (1988). Developmentally regulated expression of a human 'finger'-containing gene encoded by the 5' half of the ret transforming gene. Mol. Cell. Biol. 8: 1853—1856. PMID 3380101 DOI:10.1128/MCB.8.4.1853
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Takahashi M., Cooper G.M. (1987). ret transforming gene encodes a fusion protein homologous to tyrosine kinases. Mol. Cell. Biol. 7: 1378—1385. PMID 3037315 DOI:10.1128/MCB.7.4.1378
• Shimono Y., Murakami H., Hasegawa Y., Takahashi M. (2000). RET finger protein is a transcriptional repressor and interacts with enhancer of polycomb that has dual transcriptional functions. J. Biol. Chem. 275: 39411—39419. PMID 10976108 DOI:10.1074/jbc.M006585200
• Tezel G., Nagasaka T., Shimono Y., Takahashi M. (2002). Differential expression of RET finger protein in testicular germ cell tumors. Pathol. Int. 52: 623—627. PMID 12445133 DOI:10.1046/j.1440-1827.2002.01401.x
• Dho S.H., Kwon K.S. (2003). The Ret finger protein induces apoptosis via its RING finger-B box-coiled-coil motif. J. Biol. Chem. 278: 31902—31908. PMID 12807881 DOI:10.1074/jbc.M304062200

Див. також

• Хромосома 6