TRIP6

TRIP6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X61, 2DLO
Ідентифікатори
Символи	TRIP6, OIP-1, OIP1, TRIP-6, TRIP6i2, ZRP-1, thyroid hormone receptor interactor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 602933 MGI: 1343458 HomoloGene: 37757 GeneCards: TRIP6
Онтологія гена Молекулярна функція • kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • interleukin-1 receptor binding • зв'язування з іоном металу • thyroid hormone receptor binding • RNA binding Клітинна компонента • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • interleukin-1 receptor complex • цитоскелет • клітинне ядро • focal adhesion • цитоплазма • гіалоплазма • stress fiber Біологічний процес • focal adhesion assembly • адгезія клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of cell migration • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7205	22051
Ensembl	ENSG00000087077	ENSMUSG00000023348
UniProt	Q15654	Q9Z1Y4
RefSeq (мРНК)	NM_003302	NM_011639
RefSeq (білок)	NP_003293	NP_035769
Локус (UCSC)	Хр. 7: 100.87 – 100.87 Mb	Хр. 5: 137.31 – 137.31 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIP6 (англ. Thyroid hormone receptor interactor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 476 амінокислот, а молекулярна маса — 50 288.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGPTWLPPK		QPEPARAPQG		RAIPRGTPGP		PPAHGAALQP		HPRVNFCPLP
SEQCYQAPGG		PEDRGPAWVG		SHGVLQHTQG		LPADRGGLRP		GSLDAEIDLL
SSTLAELNGG		RGHASRRPDR		QAYEPPPPPA		YRTGSLKPNP		ASPLPASPYG
GPTPASYTTA		STPAGPAFPV		QVKVAQPVRG		CGPPRRGASQ		ASGPLPGPHF
PLPGRGEVWG		PGYRSQREPG		PGAKEEAAGV		SGPAGRGRGG		EHGPQVPLSQ
PPEDELDRLT		KKLVHDMNHP		PSGEYFGQCG		GCGEDVVGDG		AGVVALDRVF
HVGCFVCSTC		RAQLRGQHFY		AVERRAYCEG		CYVATLEKCA		TCSQPILDRI
LRAMGKAYHP		GCFTCVVCHR		GLDGIPFTVD		ATSQIHCIED		FHRKFAPRCS
VCGGAIMPEP		GQEETVRIVA		LDRSFHIGCY		KCEECGLLLS		SEGECQGCYP
LDGHILCKAC		SAWRIQELSA		TVTTDC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних контактах.

Література

• Yi J., Beckerle M.C. (1998). The human TRIP6 gene encodes a LIM domain protein and maps to chromosome 7q22, a region associated with tumorigenesis. Genomics. 49: 314—316. PMID 9598321 DOI:10.1006/geno.1998.5248
• Murthy K.K., Clark K., Fortin Y., Shen S.-H., Banville D. (1999). ZRP-1, a zyxin-related protein, interacts with the second PDZ domain of the cytosolic protein tyrosine phosphatase hPTP1E. J. Biol. Chem. 274: 20679—20687. PMID 10400701 DOI:10.1074/jbc.274.29.20679
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee J.W., Choi H.-S., Gyuris J., Brent R., Moore D.D. (1995). Two classes of proteins dependent on either the presence or absence of thyroid hormone for interaction with the thyroid hormone receptor. Mol. Endocrinol. 9: 243—254. PMID 7776974 DOI:10.1210/mend.9.2.7776974
• Xu J., Lai Y.-J., Lin W.-C., Lin F.-T. (2004). TRIP6 enhances lysophosphatidic acid-induced cell migration by interacting with the lysophosphatidic acid 2 receptor. J. Biol. Chem. 279: 10459—10468. PMID 14688263 DOI:10.1074/jbc.M311891200
• Petit M.M.R., Crombez K.R.M.O., Vervenne H.B.V.K., Weyns N., Van de Ven W.J.M. (2005). The tumor suppressor Scrib selectively interacts with specific members of the zyxin family of proteins. FEBS Lett. 579: 5061—5068. PMID 16137684 DOI:10.1016/j.febslet.2005.08.012

Див. також

• Хромосома 7