TRRAP

TRRAP
Ідентифікатори
Символи	TRRAP, PAF350/400, PAF400, STAF40, TR-AP, Tra1, transformation/transcription domain associated protein, DEDDFA, DFNA75
Зовнішні ІД	OMIM: 603015 MGI: 2153272 HomoloGene: 39246 GeneCards: TRRAP
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase • kinase activity Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • transcription factor TFTC complex • NuA4 histone acetyltransferase complex • Нуклеоплазма • клітинне ядро • Swr1 complex • histone acetyltransferase complex • SAGA complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H2A acetylation • transcription, DNA-templated • histone deubiquitination • histone H4 acetylation • фосфорилювання • beta-catenin-TCF complex assembly • histone acetylation • protein deubiquitination • GO:0100026 Репарація ДНК • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8295	100683
Ensembl	ENSG00000196367	ENSMUSG00000045482
UniProt	Q9Y4A5	Q80YV3
RefSeq (мРНК)	NM_003496 NM_001244580 NM_001375524	NM_001081362 NM_133901
RefSeq (білок)	NP_001231509 NP_003487 NP_001362453	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 7: 98.88 – 99.05 Mb	Хр. 5: 144.7 – 144.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRRAP (англ. Transformation/transcription domain associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 859 амінокислот, а молекулярна маса — 437 600.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAFVATQGAT		VVDQTTLMKK		YLQFVAALTD		VNTPDETKLK		MMQEVSENFE
NVTSSPQYST		FLEHIIPRFL		TFLQDGEVQF		LQEKPAQQLR		KLVLEIIHRI
PTNEHLRPHT		KNVLSVMFRF		LETENEENVL		ICLRIIIELH		KQFRPPITQE
IHHFLDFVKQ		IYKELPKVVN		RYFENPQVIP		ENTVPPPEMV		GMITTIAVKV
NPEREDSETR		THSIIPRGSL		SLKVLAELPI		IVVLMYQLYK		LNIHNVVAEF
VPLIMNTIAI		QVSAQARQHK		LYNKELYADF		IAAQIKTLSF		LAYIIRIYQE
LVTKYSQQMV		KGMLQLLSNC		PAETAHLRKE		LLIAAKHILT		TELRNQFIPC
MDKLFDESIL		IGSGYTARET		LRPLAYSTLA		DLVHHVRQHL		PLSDLSLAVQ
LFAKNIDDES		LPSSIQTMSC		KLLLNLVDCI		RSKSEQESGN		GRDVLMRMLE
VFVLKFHTIA		RYQLSAIFKK		CKPQSELGAV		EAALPGVPTA		PAAPGPAPSP
APVPAPPPPP		PPPPPATPVT		PAPVPPFEKQ		GEKDKEDKQT		FQVTDCRSLV
KTLVCGVKTI		TWGITSCKAP		GEAQFIPNKQ		LQPKETQIYI		KLVKYAMQAL
DIYQVQIAGN		GQTYIRVANC		QTVRMKEEKE		VLEHFAGVFT		MMNPLTFKEI
FQTTVPYMVE		RISKNYALQI		VANSFLANPT		TSALFATILV		EYLLDRLPEM
GSNVELSNLY		LKLFKLVFGS		VSLFAAENEQ		MLKPHLHKIV		NSSMELAQTA
KEPYNYFLLL		RALFRSIGGG		SHDLLYQEFL		PLLPNLLQGL		NMLQSGLHKQ
HMKDLFVELC		LTVPVRLSSL		LPYLPMLMDP		LVSALNGSQT		LVSQGLRTLE
LCVDNLQPDF		LYDHIQPVRA		ELMQALWRTL		RNPADSISHV		AYRVLGKFGG
SNRKMLKESQ		KLHYVVTEVQ		GPSITVEFSD		CKASLQLPME		KAIETALDCL
KSANTEPYYR		RQAWEVIKCF		LVAMMSLEDN		KHALYQLLAH		PNFTEKTIPN
VIISHRYKAQ		DTPARKTFEQ		ALTGAFMSAV		IKDLRPSALP		FVASLIRHYT
MVAVAQQCGP		FLLPCYQVGS		QPSTAMFHSE		ENGSKGMDPL		VLIDAIAICM
AYEEKELCKI		GEVALAVIFD		VASIILGSKE		RACQLPLFSY		IVERLCACCY
EQAWYAKLGG		VVSIKFLMER		LPLTWVLQNQ		QTFLKALLFV		MMDLTGEVSN
GAVAMAKTTL		EQLLMRCATP		LKDEERAEEI		VAAQEKSFHH		VTHDLVREVT
SPNSTVRKQA		MHSLQVLAQV		TGKSVTVIME		PHKEVLQDMV		PPKKHLLRHQ
PANAQIGLME		GNTFCTTLQP		RLFTMDLNVV		EHKVFYTELL		NLCEAEDSAL
TKLPCYKSLP		SLVPLRIAAL		NALAACNYLP		QSREKIIAAL		FKALNSTNSE
LQEAGEACMR		KFLEGATIEV		DQIHTHMRPL		LMMLGDYRSL		TLNVVNRLTS
VTRLFPNSFN		DKFCDQMMQH		LRKWMEVVVI		THKGGQRSDG		NESISECGRC
PLSPFCQFEE		MKICSAIINL		FHLIPAAPQT		LVKPLLEVVM		KTERAMLIEA
GSPFREPLIK		FLTRHPSQTV		ELFMMEATLN		DPQWSRMFMS		FLKHKDARPL
RDVLAANPNR		FITLLLPGGA		QTAVRPGSPS		TSTMRLDLQF		QAIKIISIIV
KNDDSWLASQ		HSLVSQLRRV		WVSENFQERH		RKENMAATNW		KEPKLLAYCL
LNYCKRNYGD		IELLFQLLRA		FTGRFLCNMT		FLKEYMEEEI		PKNYSIAQKR
ALFFRFVDFN		DPNFGDELKA		KVLQHILNPA		FLYSFEKGEG		EQLLGPPNPE
GDNPESITSV		FITKVLDPEK		QADMLDSLRI		YLLQYATLLV		EHAPHHIHDN
NKNRNSKLRR		LMTFAWPCLL		SKACVDPACK		YSGHLLLAHI		IAKFAIHKKI
VLQVFHSLLK		AHAMEARAIV		RQAMAILTPA		VPARMEDGHQ		MLTHWTRKII
VEEGHTVPQL		VHILHLIVQH		FKVYYPVRHH		LVQHMVSAMQ		RLGFTPSVTI
EQRRLAVDLS		EVVIKWELQR		IKDQQPDSDM		DPNSSGEGVN		SVSSSIKRGL
SVDSAQEVKR		FRTATGAISA		VFGRSQSLPG		ADSLLAKPID		KQHTDTVVNF
LIRVACQVND		NTNTAGSPGE		VLSRRCVNLL		KTALRPDMWP		KSELKLQWFD
KLLMTVEQPN		QVNYGNICTG		LEVLSFLLTV		LQSPAILSSF		KPLQRGIAAC
MTCGNTKVLR		AVHSLLSRLM		SIFPTEPSTS		SVASKYEELE		CLYAAVGKVI
YEGLTNYEKA		TNANPSQLFG		TLMILKSACS		NNPSYIDRLI		SVFMRSLQKM
VREHLNPQAA		SGSTEATSGT		SELVMLSLEL		VKTRLAVMSM		EMRKNFIQAI
LTSLIEKSPD		AKILRAVVKI		VEEWVKNNSP		MAANQTPTLR		EKSILLVKMM
TYIEKRFPED		LELNAQFLDL		VNYVYRDETL		SGSELTAKLE		PAFLSGLRCA
QPLIRAKFFE		VFDNSMKRRV		YERLLYVTCS		QNWEAMGNHF		WIKQCIELLL
AVCEKSTPIG		TSCQGAMLPS		ITNVINLADS		HDRAAFAMVT		HVKQEPRERE
NSESKEEDVE		IDIELAPGDQ		TSTPKTKELS		EKDIGNQLHM		LTNRHDKFLD
TLREVKTGAL		LSAFVQLCHI		STTLAEKTWV		QLFPRLWKIL		SDRQQHALAG
EISPFLCSGS		HQVQRDCQPS		ALNCFVEAMS		QCVPPIPIRP		CVLKYLGKTH
NLWFRSTLML		EHQAFEKGLS		LQIKPKQTTE		FYEQESITPP		QQEILDSLAE
LYSLLQEEDM		WAGLWQKRCK		YSETATAIAY		EQHGFFEQAQ		ESYEKAMDKA
KKEHERSNAS		PAIFPEYQLW		EDHWIRCSKE		LNQWEALTEY		GQSKGHINPY
LVLECAWRVS		NWTAMKEALV		QVEVSCPKEM		AWKVNMYRGY		LAICHPEEQQ
LSFIERLVEM		ASSLAIREWR		RLPHVVSHVH		TPLLQAAQQI		IELQEAAQIN
AGLQPTNLGR		NNSLHDMKTV		VKTWRNRLPI		VSDDLSHWSS		IFMWRQHHYQ
GKPTWSGMHS		SSIVTAYENS		SQHDPSSNNA		MLGVHASASA		IIQYGKIARK
QGLVNVALDI		LSRIHTIPTV		PIVDCFQKIR		QQVKCYLQLA		GVMGKNECMQ
GLEVIESTNL		KYFTKEMTAE		FYALKGMFLA		QINKSEEANK		AFSAAVQMHD
VLVKAWAMWG		DYLENIFVKE		RQLHLGVSAI		TCYLHACRHQ		NESKSRKYLA
KVLWLLSFDD		DKNTLADAVD		KYCIGVPPIQ		WLAWIPQLLT		CLVGSEGKLL
LNLISQVGRV		YPQAVYFPIR		TLYLTLKIEQ		RERYKSDPGP		IRATAPMWRC
SRIMHMQREL		HPTLLSSLEG		IVDQMVWFRE		NWHEEVLRQL		QQGLAKCYSV
AFEKSGAVSD		AKITPHTLNF		VKKLVSTFGV		GLENVSNVST		MFSSAASESL
ARRAQATAQD		PVFQKLKGQF		TTDFDFSVPG		SMKLHNLISK		LKKWIKILEA
KTKQLPKFFL		IEEKCRFLSN		FSAQTAEVEI		PGEFLMPKPT		HYYIKIARFM
PRVEIVQKHN		TAARRLYIRG		HNGKIYPYLV		MNDACLTESR		REERVLQLLR
LLNPCLEKRK		ETTKRHLFFT		VPRVVAVSPQ		MRLVEDNPSS		LSLVEIYKQR
CAKKGIEHDN		PISRYYDRLA		TVQARGTQAS		HQVLRDILKE		VQSNMVPRSM
LKEWALHTFP		NATDYWTFRK		MFTIQLALIG		FAEFVLHLNR		LNPEMLQIAQ
DTGKLNVAYF		RFDINDATGD		LDANRPVPFR		LTPNISEFLT		TIGVSGPLTA
SMIAVARCFA		QPNFKVDGIL		KTVLRDEIIA		WHKKTQEDTS		SPLSAAGQPE
NMDSQQLVSL		VQKAVTAIMT		RLHNLAQFEG		GESKVNTLVA		AANSLDNLCR
MDPAWHPWL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• McMahon S.B., Van Buskirk H.A., Dugan K.A., Copeland T.D., Cole M.D. (1998). The novel ATM-related protein TRRAP is an essential cofactor for the c-Myc and E2F oncoproteins. Cell. 94: 363—374. PMID 9708738 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81479-8
• Brand M., Yamamoto K., Staub A., Tora L. (1999). Identification of TATA-binding protein-free TAFII-containing complex subunits suggests a role in nucleosome acetylation and signal transduction. J. Biol. Chem. 274: 18285—18289. PMID 10373431 DOI:10.1074/jbc.274.26.18285
• McMahon S.B., Wood M.A., Cole M.D. (2000). The essential cofactor TRRAP recruits the histone acetyltransferase hGCN5 to c-Myc. Mol. Cell. Biol. 20: 556—562. PMID 10611234 DOI:10.1128/MCB.20.2.556-562.2000
• Lang S.E., McMahon S.B., Cole M.D., Hearing P. (2001). E2F transcriptional activation requires TRRAP and GCN5 cofactors. J. Biol. Chem. 276: 32627—32634. PMID 11418595 DOI:10.1074/jbc.M102067200
• Park J., Kunjibettu S., McMahon S.B., Cole M.D. (2001). The ATM-related domain of TRRAP is required for histone acetyltransferase recruitment and Myc-dependent oncogenesis. Genes Dev. 15: 1619—1624. PMID 11445536 DOI:10.1101/gad.900101
• Park J., Wood M.A., Cole M.D. (2002). BAF53 forms distinct nuclear complexes and functions as a critical c-Myc-interacting nuclear cofactor for oncogenic transformation. Mol. Cell. Biol. 22: 1307—1316. PMID 11839798 DOI:10.1128/MCB.22.5.1307-1316.2002

Див. також

• Хромосома 7