TSNAX

TSNAX
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3PJA, 3QB5
Ідентифікатори
Символи	TSNAX, TRAX, translin-associated factor X, translin associated factor X, C3PO
Зовнішні ІД	OMIM: 602964 MGI: 1855672 HomoloGene: 4374 GeneCards: TSNAX
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding • single-stranded DNA binding • endoribonuclease activity • A2A adenosine receptor binding • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • клітинне ядро Біологічний процес • multicellular organism development • диференціація клітин • Сперматогенез • protein transport • GO:0070919 production of siRNA involved in RNA interference • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7257	53424
Ensembl	ENSG00000116918	ENSMUSG00000056820
UniProt	Q99598	Q9QZE7
RefSeq (мРНК)	NM_005999	NM_016909
RefSeq (білок)	NP_005990	NP_058605
Локус (UCSC)	Хр. 1: 231.53 – 231.57 Mb	Хр. 8: 125.74 – 125.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TSNAX (англ. Translin associated factor X) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 290 амінокислот, а молекулярна маса — 33 112.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSNKEGSGGF		RKRKHDNFPH		NQRREGKDVN		SSSPVMLAFK		SFQQELDARH
DKYERLVKLS		RDITVESKRT		IFLLHRITSA		PDMEDILTES		EIKLDGVRQK
IFQVAQELSG		EDMHQFHRAI		TTGLQEYVEA		VSFQHFIKTR		SLISMDEINK
QLIFTTEDNG		KENKTPSSDA		QDKQFGTWRL		RVTPVDYLLG		VADLTGELMR
MCINSVGNGD		IDTPFEVSQF		LRQVYDGFSF		IGNTGPYEVS		KKLYTLKQSL
AKVENACYAL		KVRGSEIPKH		MLADVFSVKT		EMIDQEEGIS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, сперматогенез. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, апараті гольджі.

Література

• Aoki K., Ishida R., Kasai M. (1997). Isolation and characterization of a cDNA encoding a translin-like protein, TRAX. FEBS Lett. 401: 109—112. PMID 9013868 DOI:10.1016/S0014-5793(96)01444-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bray J.D., Chennathukuzhi V.M., Hecht N.B. (2002). Identification and characterization of cDNAs encoding four novel proteins that interact with translin associated factor-X. Genomics. 79: 799—808. PMID 12036294 DOI:10.1006/geno.2002.6779
• Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates. J. Biol. Chem. 280: 5004—5012. PMID 15561718 DOI:10.1074/jbc.M411718200
• Erdemir T., Bilican B., Oncel D., Goding C.R., Yavuzer U. (2002). DNA damage-dependent interaction of the nuclear matrix protein C1D with Translin-associated factor X (TRAX). J. Cell Sci. 115: 207—216. PMID 11801738

Див. також

• Хромосома 1