TTF2

TTF2
Ідентифікатори
Символи	TTF2, HuF2, ZGRF6, transcription termination factor, RNA polymerase II, transcription termination factor 2, F2
Зовнішні ІД	OMIM: 604718 MGI: 1921294 HomoloGene: 37826 GeneCards: TTF2
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • ATP-dependent activity, acting on DNA • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • spliceosomal complex • transcription elongation factor complex • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • DNA-templated transcription, termination • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8458	74044
Ensembl	ENSG00000116830	ENSMUSG00000033222
UniProt	Q9UNY4	Q5NC05
RefSeq (мРНК)	NM_003594	NM_001013026
RefSeq (білок)	NP_003585	NP_001013044
Локус (UCSC)	Хр. 1: 117.06 – 117.11 Mb	Хр. 3: 100.94 – 100.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TTF2 (англ. Transcription termination factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 162 амінокислот, а молекулярна маса — 129 588.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEVRCPEHG		TFCFLKTGVR		DGPNKGKSFY		VCRADTCSFV		RATDIPVSHC
LLHEDFVVEL		QGLLLPQDKK		EYRLFFRCIR		SKAEGKRWCG		SIPWQDPDSK
EHSVSNKSQH		ASETFHHSSN		WLRNPFKVLD		KNQEPALWKQ		LIKGEGEEKK
ADKKQREKGD		QLFDQKKEQK		PEMMEKDLSS		GLVPKKKQSV		VQEKKQEEGA
EIQCEAETGG		THKRDFSEIK		SQQCQGNELT		RPSASSQEKS		SGKSQDVQRE
SEPLREKVTQ		LLPQNVHSHN		SISKPQKGGP		LNKEYTNWEA		KETKAKDGPS
IQATQKSLPQ		GHFQERPETH		SVPAPGGPAA		QAAPAAPGLS		LGEGREAATS
SDDEEEDDVV		FVSSKPGSPL		LFDSTLDLET		KENLQFPDRS		VQRKVSPASG
VSKKVEPSDP		VARRVYLTTQ		LKQKKSTLAS		VNIQALPDKG		QKLIKQIQEL
EEVLSGLTLS		PEQGTNEKSN		SQVPQQSHFT		KTTTGPPHLV		PPQPLPRRGT
QPVGSLELKS		ACQVTAGGSS		QCYRGHTNQD		HVHAVWKITS		EAIGQLHRSL
ESCPGETVVA		EDPAGLKVPL		LLHQKQALAW		LLWRESQKPQ		GGILADDMGL
GKTLTMIALI		LTQKNQEKKE		EKEKSTALTW		LSKDDSCDFT		SHGTLIICPA
SLIHHWKNEV		EKRVNSNKLR		VYLYHGPNRD		SRARVLSTYD		IVITTYSLVA
KEIPTNKQEA		EIPGANLNVE		GTSTPLLRIA		WARIILDEAH		NVKNPRVQTS
IAVCKLQACA		RWAVTGTPIQ		NNLLDMYSLL		KFLRCSPFDE		FNLWRSQVDN
GSKKGGERLS		ILTKSLLLRR		TKDQLDSTGR		PLVILPQRKF		QLHHLKLSED
EETVYNVFFA		RSRSALQSYL		KRHESRGNQS		GRSPNNPFSR		VALEFGSEEP
RHSEAADSPR		SSTVHILSQL		LRLRQCCCHL		SLLKSALDPM		ELKGEGLVLS
LEEQLSALTL		SELRDSEPSS		TVSLNGTFFK		MELFEGMRES		TKISSLLAEL
EAIQRNSASQ		KSVIVSQWTN		MLKVVALHLK		KHGLTYATID		GSVNPKQRMD
LVEAFNHSRG		PQVMLISLLA		GGVGLNLTGG		NHLFLLDMHW		NPSLEDQACD
RIYRVGQQKD		VVIHRFVCEG		TVEEKILQLQ		EKKKDLAKQV		LSGSGESVTK
LTLADLRVLF		GI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Liu M., Xie Z., Price D.H. (1998). A human RNA polymerase II transcription termination factor is a SWI2/SNF2 family member. J. Biol. Chem. 273: 25541—25544. PMID 9748214 DOI:10.1074/jbc.273.40.25541
• Leonard D., Ajuh P., Lamond A.I., Legerski R.J. (2003). hLodestar/HuF2 interacts with CDC5L and is involved in pre-mRNA splicing. Biochem. Biophys. Res. Commun. 308: 793—801. PMID 12927788 DOI:10.1016/S0006-291X(03)01486-4
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hara R., Selby C.P., Liu M., Price D.H., Sancar A. (1999). Human transcription release factor 2 dissociates RNA polymerases I and II stalled at a cyclobutane thymine dimer. J. Biol. Chem. 274: 24779—24786. PMID 10455150 DOI:10.1074/jbc.274.35.24779
• Jiang Y., Liu M., Spencer C.A., Price D.H. (2004). Involvement of transcription termination factor 2 in mitotic repression of transcription elongation. Mol. Cell. 14: 375—385. PMID 15125840 DOI:10.1016/S1097-2765(04)00234-5

Див. також

• Хромосома 1