TWISTNB

TWISTNB
Ідентифікатори
Символи	POLR1F, TWIST neighbor, RPA43, RNA polymerase I subunit F, A43, TWISTNB
Зовнішні ІД	OMIM: 608312 MGI: 106292 HomoloGene: 45411 GeneCards: POLR1F
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • RNA polymerase I activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • RNA polymerase I complex • клітинне ядро • ядерце Біологічний процес • termination of RNA polymerase I transcription • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • transcription, DNA-templated • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • cellular response to leukemia inhibitory factor • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	221830	28071
Ensembl	ENSG00000105849	ENSMUSG00000020561
UniProt	Q3B726	Q78WZ7
RefSeq (мРНК)	NM_001002926	NM_172253
RefSeq (білок)	NP_001002926	NP_758457
Локус (UCSC)	Хр. 7: 19.7 – 19.71 Mb	Хр. 12: 33.48 – 33.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TWISTNB (англ. TWIST neighbor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 7-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 37 432.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAGCSEAPR		PAAASDGSLV		GQAGVLPCLE		LPTYAAACAL		VNSRYSCLVA
GPHQRHIALS		PRYLNRKRTG		IREQLDAELL		RYSESLLGVP		IAYDNIKVVG
ELGDIYDDQG		HIHLNIEADF		VIFCPEPGQK		LMGIVNKVSS		SHIGCLVHGC
FNASIPKPEQ		LSAEQWQTME		INMGDELEFE		VFRLDSDAAG		VFCIRGKLNI
TSLQFKRSEV		SEEVTENGTE		EAAKKPKKKK		KKKDPETYEV		DSGTTKLADD
ADDTPMEESA		LQNTNNANGI		WEEEPKKKKK		KKKHQEVQDQ		DPVFQGSDSS
GYQSDHKKKK		KKRKHSEEAE		FTPPLKCSPK		RKGKSNFL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як транскрипція. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kosan C., Kunz J. (2002). Identification and characterisation of the gene TWIST NEIGHBOR (TWISTNB) located in the microdeletion syndrome 7p21 region. Cytogenet. Genome Res. 97: 167—170. PMID 12438708 DOI:10.1159/000066618
• Yuan X., Zhao J., Zentgraf H., Hoffmann-Rohrer U., Grummt I. (2002). Multiple interactions between RNA polymerase I, TIF-IA and TAF(I) subunits regulate preinitiation complex assembly at the ribosomal gene promoter. EMBO Rep. 3: 1082—1087. PMID 12393749 DOI:10.1093/embo-reports/kvf212

Див. також

• Хромосома 7