UBE2W

UBE2W
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2A7L, 2MT6
Ідентифікатори
Символи	UBE2W, UBC-16, UBC16, ubiquitin conjugating enzyme E2 W (putative), ubiquitin conjugating enzyme E2 W
Зовнішні ІД	OMIM: 614277 MGI: 1914049 HomoloGene: 10119 GeneCards: UBE2W
шифр КФ	2.3.2.25
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • ubiquitin protein ligase binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • ubiquitin conjugating enzyme activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • protein K11-linked ubiquitination • protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins • protein monoubiquitination • GO:0100026 Репарація ДНК • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • cellular response to DNA damage stimulus • cellular response to misfolded protein • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55284	66799
Ensembl	ENSG00000104343	ENSMUSG00000025939
UniProt	Q96B02 Q96FI0	Q8VDW4
RefSeq (мРНК)	NM_001001481 NM_001001482 NM_001271015 NM_018299	NM_001271016 NM_001271017 NM_025773
RefSeq (білок)	NP_001001481 NP_001257944 NP_060769 NP_001257944.1	NP_001257945 NP_001257946 NP_080049
Локус (UCSC)	Хр. 8: 73.78 – 73.88 Mb	Хр. 1: 16.61 – 16.69 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UBE2W (англ. Ubiquitin conjugating enzyme E2 W) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 151 амінокислот, а молекулярна маса — 17 331.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASMQKRLQK		ELLALQNDPP		PGMTLNEKSV		QNSITQWIVD		MEGAPGTLYE
GEKFQLLFKF		SSRYPFDSPQ		VMFTGENIPV		HPHVYSNGHI		CLSILTEDWS
PALSVQSVCL		SIISMLSSCK		EKRRPPDNSF		YVRTCNKNPK		KTKWWYHDDT
C

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Alpi A.F., Pace P.E., Babu M.M., Patel K.J. (2008). Mechanistic insight into site-restricted monoubiquitination of FANCD2 by Ube2t, FANCL, and FANCI. Mol. Cell. 32: 767—777. PMID 19111657 DOI:10.1016/j.molcel.2008.12.003
• David Y., Ziv T., Admon A., Navon A. (2010). The E2 ubiquitin-conjugating enzymes direct polyubiquitination to preferred lysines. J. Biol. Chem. 285: 8595—8604. PMID 20061386 DOI:10.1074/jbc.M109.089003
• Tatham M.H., Plechanovova A., Jaffray E.G., Salmen H., Hay R.T. (2013). Ube2W conjugates ubiquitin to alpha-amino groups of protein N-termini. Biochem. J. 453: 137—145. PMID 23560854 DOI:10.1042/BJ20130244

Див. також

• Хромосома 8