UBN1

UBN1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4ZBJ
Ідентифікатори
Символи	UBN1, VT, VT4, ubinuclein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609771 MGI: 1891307 HomoloGene: 9656 GeneCards: UBN1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • міжклітинні контакти • PML body • клітинне ядро • bicellular tight junction • нуклеоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0022415 viral process • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29855	170644
Ensembl	ENSG00000118900	ENSMUSG00000039473
UniProt	Q9NPG3	Q4G0F8
RefSeq (мРНК)	NM_001079514 NM_001288656 NM_016936	NM_026666 NM_001356320
RefSeq (білок)	NP_001072982 NP_001275585	NP_080942 NP_001343249
Локус (UCSC)	Хр. 16: 4.85 – 4.88 Mb	Хр. 16: 5.05 – 5.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UBN1 (англ. Ubinuclein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 134 амінокислот, а молекулярна маса — 121 520.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSEPHRVQFT		SLPGSLNPAF		LKKSRKEEAG		AGEQHQDCEP		AAAAVRITLT
LFEPDHKRCP		EFFYPELVKN		IRGKVKGLQP		GDKKKDLSDP		FNDEEKERHK
VEALARKFEE		KYGGKKRRKD		RIQDLIDMGY		GYDESDSFID		NSEAYDELVP
ASLTTKYGGF		YINSGTLQFR		QASESEDDFI		KEKKKKSPKK		RKLKEGGEKI
KKKKKDDTYD		KEKKSKKSKF		SKAGFTALNA		SKEKKKKKYS		GALSVKEMLK
KFQKEKEAQK		KREEEHKPVA		VPSAEAQGLR		ELEGASDPLL		SLFGSTSDND
LLQAATAMDS		LTDLDLEHLL		SESPEGSPFR		DMDDGSDSLG		VGLDQEFRQP
SSLPEGLPAP		LEKRVKELAQ		AARAAEGESR		QKFFTQDING		ILLDIEAQTR
ELSSQVRSGV		YAYLASFLPC		SKDALLKRAR		KLHLYEQGGR		LKEPLQKLKE
AIGRAMPEQM		AKYQDECQAH		TQAKVAKMLE		EEKDKEQRDR		ICSDEEEDEE
KGGRRIMGPR		KKFQWNDEIR		ELLCQVVKIK		LESQDLERNN		KAQAWEDCVK
GFLDAEVKPL		WPKGWMQART		LFKESRRGHG		HLTSILAKKK		VMAPSKIKVK
ESSTKPDKKV		SVPSGQIGGP		IALPSDHQTG		GLSIGASSRE		LPSQASGGLA
NPPPVNLEDS		LDEDLIRNPA		SSVEAVSKEL		AALNSRAAGN		SEFTLPAPSK
APAEKVGGVL		CTEEKRNFAK		PSPSAPPPAS		SLQSPLNFLA		EQALALGQSS
QEKKPESSGY		KELSCQAPLN		KGLPEVHQSK		AKHHSLPRTS		HGPQVAVPVP
GPQVKVFHAG		TQQQKNFTPP		SPFANKLQGP		KASPTQCHRS		LLQLVKTAAK
GQGFHPSAPA		TSGGLSASSS		SSHKTPASSS		SALSHPAKPH		SVSSAGSSYK
NNPFASSISK		HGVSSGSSSS		GGTPVQSSVS		GSLVPGIQPP		SVGQATSRPV
PSSAGKKMPV		SQKLTLVAPP		GGPNGDSSGG		TQGVAKLLTS		PSLKPSAVSS
VTSSTSLSKG		ASGTVLLAGS		SLMASPYKSS		SPKLSGAMSS		NSLGIITPVP
IPVHVLSFSA		DSSAKAGVSK		DAIVTGPAPG		SFHHGLGHSL		LAGLHSSPPH
AAPLPHAAVP		THIPQSLPGA		SQLHGKGPAV		PRKL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

• Tagami H., Ray-Gallet D., Almouzni G., Nakatani Y. (2004). Histone H3.1 and H3.3 complexes mediate nucleosome assembly pathways dependent or independent of DNA synthesis. Cell. 116: 51—61. PMID 14718166 DOI:10.1016/S0092-8674(03)01064-X

Див. також

• Хромосома 16