UBP1

UBP1
Ідентифікатори
Символи	UBP1, LBP-1B, LBP-1a, LBP1A, LBP1B, upstream binding protein 1 (LBP-1a), upstream binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609784 MGI: 104889 HomoloGene: 8435 GeneCards: UBP1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • viral genome replication • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Ангіогенез • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7342	22221
Ensembl	ENSG00000153560	ENSMUSG00000009741
UniProt	Q9NZI7	Q811S7
RefSeq (мРНК)	NM_001128160 NM_001128161 NM_014517	NM_001083319 NM_013699 NM_001372507 NM_001372508 NM_001372510 NM_001372511 NM_001372512 NM_001372514
RefSeq (білок)	NP_001121632 NP_001121633 NP_055332	NP_001076788 NP_038727 NP_001359436 NP_001359437 NP_001359439 NP_001359440 NP_001359441 NP_001359443
Локус (UCSC)	Хр. 3: 33.39 – 33.44 Mb	Хр. 9: 113.76 – 113.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UBP1 (англ. Upstream binding protein 1 (LBP-1a)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 60 491.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAWVLKMDEV		IESGLVHDFD		ASLSGIGQEL		GAGAYSMSDV		LALPIFKQED
SSLPLDGETE		HPPFQYVMCA		ATSPAVKLHD		ETLTYLNQGQ		SYEIRMLDNR
KMGDMPEING		KLVKSIIRVV		FHDRRLQYTE		HQQLEGWKWN		RPGDRLLDLD
IPMSVGIIDT		RTNPSQLNAV		EFLWDPAKRT		SAFIQVHCIS		TEFTPRKHGG
EKGVPFRIQV		DTFKQNENGE		YTDHLHSASC		QIKVFKPKGA		DRKQKTDREK
MEKRTAHEKE		KYQPSYDTTI		LTEMRLEPII		EDAVEHEQKK		SSKRTLPADY
GDSLAKRGSC		SPWPDAPTAY		VNNSPSPAPT		FTSPQQSTCS		VPDSNSSSPN
HQGDGASQTS		GEQIQPSATI		QETQQWLLKN		RFSSYTRLFS		NFSGADLLKL
TKEDLVQICG		AADGIRLYNS		LKSRSVRPRL		TIYVCREQPS		STVLQGQQQA
ASSASENGSG		APYVYHAIYL		EEMIASEVAR		KLALVFNIPL		HQINQVYRQG
PTGIHILVSD		QMVQNFQDES		CFLFSTVKAE		SSDGIHIILK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Yoon J.-B., Li G., Roeder R.G. (1994). Characterization of a family of related cellular transcription factors which can modulate human immunodeficiency virus type 1 transcription in vitro. Mol. Cell. Biol. 14: 1776—1785. PMID 8114710 DOI:10.1128/MCB.14.3.1776
• Huang N., Miller W.L. (2000). Cloning of factors related to HIV-inducible LBP proteins that regulate steroidogenic factor-1-independent human placental transcription of the cholesterol side-chain cleavage enzyme, P450scc. J. Biol. Chem. 275: 2852—2858. PMID 10644752 DOI:10.1074/jbc.275.4.2852
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kato H., Horikoshi M., Roeder R.G. (1991). Repression of HIV-1 transcription by a cellular protein. Science. 251: 1476—1479. PMID 2006421 DOI:10.1126/science.2006421

Див. також

• Хромосома 3