UBQLN4

UBQLN4
Ідентифікатори
Символи	UBQLN4, A1U, A1Up, C1orf6, CIP75, UBIN, Ubiquilin 4
Зовнішні ІД	OMIM: 605440 MGI: 2150152 HomoloGene: 41346 GeneCards: UBQLN4
Онтологія гена Молекулярна функція • polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • autophagosome • nuclear proteasome complex • cytosolic proteasome complex • гіалоплазма • endoplasmic reticulum membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • хромосома • site of DNA damage Біологічний процес • автофагія • negative regulation of autophagosome maturation • regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • negative regulation of double-strand break repair via homologous recombination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56893	94232
Ensembl	ENSG00000160803	ENSMUSG00000008604
UniProt	Q9NRR5	Q99NB8
RefSeq (мРНК)	NM_001304342 NM_020131	NM_033526
RefSeq (білок)	NP_001291271 NP_064516	NP_277068
Локус (UCSC)	Хр. 1: 156.04 – 156.05 Mb	Хр. 3: 88.46 – 88.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UBQLN4 (англ. Ubiquilin 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 601 амінокислот, а молекулярна маса — 63 853.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEPSGAETR		PPIRVTVKTP		KDKEEIVICD		RASVKEFKEE		ISRRFKAQQD
QLVLIFAGKI		LKDGDTLNQH		GIKDGLTVHL		VIKTPQKAQD		PAAATASSPS
TPDPASAPST		TPASPATPAQ		PSTSGSASSD		AGSGSRRSSG		GGPSPGAGEG
SPSATASILS		GFGGILGLGS		LGLGSANFME		LQQQMQRQLM		SNPEMLSQIM
ENPLVQDMMS		NPDLMRHMIM		ANPQMQQLME		RNPEISHMLN		NPELMRQTME
LARNPAMMQE		MMRNQDRALS		NLESIPGGYN		ALRRMYTDIQ		EPMFSAAREQ
FGNNPFSSLA		GNSDSSSSQP		LRTENREPLP		NPWSPSPPTS		QAPGSGGEGT
GGSGTSQVHP		TVSNPFGINA		ASLGSGMFNS		PEMQALLQQI		SENPQLMQNV
ISAPYMRSMM		QTLAQNPDFA		AQMMVNVPLF		AGNPQLQEQL		RLQLPVFLQQ
MQNPESLSIL		TNPRAMQALL		QIQQGLQTLQ		TEAPGLVPSL		GSFGISRTPA
PSAGSNAGST		PEAPTSSPAT		PATSSPTGAS		SAQQQLMQQM		IQLLAGSGNS
QVQTPEVRFQ		QQLEQLNSMG		FINREANLQA		LIATGGDINA		AIERLLGSQL
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як автофагія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Riley B.E., Xu Y., Zoghbi H.Y., Orr H.T. (2004). The effects of the polyglutamine repeat protein ataxin-1 on the UbL-UBA protein A1Up. J. Biol. Chem. 279: 42290—42301. PMID 15280365 DOI:10.1074/jbc.M406284200
• Kim T.Y., Kim E., Yoon S.K., Yoon J.B. (2008). Herp enhances ER-associated protein degradation by recruiting ubiquilins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 369: 741—746. PMID 18307982 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.02.086
• Lee D.Y., Arnott D., Brown E.J. (2013). Ubiquilin4 is an adaptor protein that recruits Ubiquilin1 to the autophagy machinery. EMBO Rep. 14: 373—381. PMID 23459205 DOI:10.1038/embor.2013.22
• Marin I. (2014). The ubiquilin gene family: evolutionary patterns and functional insights. BMC Evol. Biol. 14: 63—63. PMID 24674348 DOI:10.1186/1471-2148-14-63

Див. також

• Хромосома 1