UHRF1

UHRF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2FAZ, 2L3R, 2LGG, 2LGK, 2LGL, 2PB7, 3ASK, 3ASL, 3BI7, 3CLZ, 3DB3, 3DB4, 3DWH, 3FL2, 3SHB, 3SOU, 3SOW, 3SOX, 3T6R, 3ZVY, 3ZVZ, 4GY5, 4QQD, 5C6D, 5IAY
Ідентифікатори
Символи	UHRF1, ICBP90, Np95, RNF106, hNP95, hhuNp95, TDRD22, ubiquitin like with PHD and ring finger domains 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607990 MGI: 1338889 HomoloGene: 7866 GeneCards: UHRF1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • hemi-methylated DNA-binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • methyl-CpG binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • methylated histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • transferase activity • zinc ion binding • GO:0031493 histone binding Клітинна компонента • GO:0035327 Еухроматин • nuclear matrix • replication fork • GO:0035328 Гетерохроматин • клітинне ядро Біологічний процес • histone monoubiquitination • GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • maintenance of DNA methylation • positive regulation of DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly • cellular response to DNA damage stimulus • Убіквітин-залежний протеоліз • клітинний цикл • проліферація • histone ubiquitination • GO:0100026 Репарація ДНК • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • protein autoubiquitination • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of epithelial cell proliferation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29128	18140
Ensembl	ENSG00000276043	ENSMUSG00000001228
UniProt	Q96T88	Q8VDF2
RefSeq (мРНК)	NM_001048201 NM_001290050 NM_001290051 NM_001290052 NM_013282	NM_001111078 NM_001111079 NM_001111080 NM_010931
RefSeq (білок)	NP_001041666 NP_001276979 NP_001276980 NP_001276981 NP_037414	NP_001104548 NP_001104549 NP_001104550 NP_035061
Локус (UCSC)	Хр. 19: 4.9 – 4.96 Mb	Хр. 17: 56.61 – 56.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UHRF1 (англ. Ubiquitin like with PHD and ring finger domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 793 амінокислот, а молекулярна маса — 89 814.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWIQVRTMDG		RQTHTVDSLS		RLTKVEELRR		KIQELFHVEP		GLQRLFYRGK
QMEDGHTLFD		YEVRLNDTIQ		LLVRQSLVLP		HSTKERDSEL		SDTDSGCCLG
QSESDKSSTH		GEAAAETDSR		PADEDMWDET		ELGLYKVNEY		VDARDTNMGA
WFEAQVVRVT		RKAPSRDEPC		SSTSRPALEE		DVIYHVKYDD		YPENGVVQMN
SRDVRARART		IIKWQDLEVG		QVVMLNYNPD		NPKERGFWYD		AEISRKRETR
TARELYANVV		LGDDSLNDCR		IIFVDEVFKI		ERPGEGSPMV		DNPMRRKSGP
SCKHCKDDVN		RLCRVCACHL		CGGRQDPDKQ		LMCDECDMAF		HIYCLDPPLS
SVPSEDEWYC		PECRNDASEV		VLAGERLRES		KKKAKMASAT		SSSQRDWGKG
MACVGRTKEC		TIVPSNHYGP		IPGIPVGTMW		RFRVQVSESG		VHRPHVAGIH
GRSNDGAYSL		VLAGGYEDDV		DHGNFFTYTG		SGGRDLSGNK		RTAEQSCDQK
LTNTNRALAL		NCFAPINDQE		GAEAKDWRSG		KPVRVVRNVK		GGKNSKYAPA
EGNRYDGIYK		VVKYWPEKGK		SGFLVWRYLL		RRDDDEPGPW		TKEGKDRIKK
LGLTMQYPEG		YLEALANRER		EKENSKREEE		EQQEGGFASP		RTGKGKWKRK
SAGGGPSRAG		SPRRTSKKTK		VEPYSLTAQQ		SSLIREDKSN		AKLWNEVLAS
LKDRPASGSP		FQLFLSKVEE		TFQCICCQEL		VFRPITTVCQ		HNVCKDCLDR
SFRAQVFSCP		ACRYDLGRSY		AMQVNQPLQT		VLNQLFPGYG		NGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Unoki M., Nishidate T., Nakamura Y. (2004). ICBP90, an E2F-1 target, recruits HDAC1 and binds to methyl-CpG through its SRA domain. Oncogene. 23: 7601—7610. PMID 15361834 DOI:10.1038/sj.onc.1208053
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Karagianni P., Amazit L., Qin J., Wong J. (2008). ICBP90, a novel methyl K9 H3 binding protein linking protein ubiquitination with heterochromatin formation. Mol. Cell. Biol. 28: 705—717. PMID 17967883 DOI:10.1128/MCB.01598-07
• Kim J.K., Esteve P.O., Jacobsen S.E., Pradhan S. (2009). UHRF1 binds G9a and participates in p21 transcriptional regulation in mammalian cells. Nucleic Acids Res. 37: 493—505. PMID 19056828 DOI:10.1093/nar/gkn961
• Guan D., Factor D., Liu Y., Wang Z., Kao H.Y. (2013). The epigenetic regulator UHRF1 promotes ubiquitination-mediated degradation of the tumor-suppressor protein promyelocytic leukemia protein. Oncogene. 32: 3819—3828. PMID 22945642 DOI:10.1038/onc.2012.406

Див. також

• Хромосома 19