UIMC1

UIMC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MKF, 2MKG, 2RR9, 2N9E
Ідентифікатори
Символи	UIMC1, RAP80, X2HRIP110, ubiquitin interaction motif containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609433 MGI: 103185 HomoloGene: 9455 GeneCards: UIMC1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0031493 histone binding • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • BRCA1-A complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • response to ionizing radiation • GO:1900404 positive regulation of DNA repair • histone H2A K63-linked deubiquitination • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • double-strand break repair • GO:0100026 Репарація ДНК • protein deubiquitination • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51720	20184
Ensembl	ENSG00000087206	ENSMUSG00000025878
UniProt	Q96RL1	Q5U5Q9
RefSeq (мРНК)	NM_001199297 NM_001199298 NM_016290 NM_001317961	NM_001293660 NM_011307 NM_001359757 NM_001359758
RefSeq (білок)	NP_001186226 NP_001186227 NP_001304890 NP_057374	NP_001280589 NP_035437 NP_001346686 NP_001346687
Локус (UCSC)	Хр. 5: 176.91 – 177.02 Mb	Хр. 13: 55.18 – 55.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UIMC1 (англ. Ubiquitin interaction motif containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 719 амінокислот, а молекулярна маса — 79 727.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRRKKKVKE		VSESRNLEKK		DVETTSSVSV		KRKRRLEDAF		IVISDSDGEE
PKEENGLQKT		KTKQSNRAKC		LAKRKIAQMT		EEEQFALALK		MSEQEAREVN
SQEEEEEELL		RKAIAESLNS		CRPSDASATR		SRPLATGPSS		QSHQEKTTDS
GLTEGIWQLV		PPSLFKGSHI		SQGNEAEERE		EPWDHTEKTE		EEPVSGSSGS
WDQSSQPVFE		NVNVKSFDRC		TGHSAEHTQC		GKPQESTGRG		SAFLKAVQGS
GDTSRHCLPT		LADAKGLQDT		GGTVNYFWGI		PFCPDGVDPN		QYTKVILCQL
EVYQKSLKMA		QRQLLNKKGF		GEPVLPRPPS		LIQNECGQGE		QASEKNECIS
EDMGDEDKEE		RQESRASDWH		SKTKDFQESS		IKSLKEKLLL		EEEPTTSHGQ
SSQGIVEETS		EEGNSVPASQ		SVAALTSKRS		LVLMPESSAE		EITVCPETQL
SSSETFDLER		EVSPGSRDIL		DGVRIIMADK		EVGNKEDAEK		EVAISTFSSS
NQVSCPLCDQ		CFPPTKIERH		AMYCNGLMEE		DTVLTRRQKE		AKTKSDSGTA
AQTSLDIDKN		EKCYLCKSLV		PFREYQCHVD		SCLQLAKADQ		GDGPEGSGRA
CSTVEGKWQQ		RLKNPKEKGH		SEGRLLSFLE		QSEHKTSDAD		IKSSETGAFR
VPSPGMEEAG		CSREMQSSFT		RRDLNESPVK		SFVSISEATD		CLVDFKKQVT
VQPGSRTRTK		AGRGRRRKF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у ядрі.

Література

• Yan Z., Kim Y.-S., Jetten A.M. (2002). RAP80: a novel nuclear protein that interacts with the retinoid-related testis-associated receptor. J. Biol. Chem. 277: 32379—32388. PMID 12080054 DOI:10.1074/jbc.M203475200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yan J., Yang X.-P., Kim Y.-S., Joo J.H., Jetten A.M. (2007). RAP80 interacts with the SUMO-conjugating enzyme UBC9 and is a novel target for sumoylation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 362: 132—138. PMID 17698038 DOI:10.1016/j.bbrc.2007.07.158
• Liu Z., Wu J., Yu X. (2007). CCDC98 targets BRCA1 to DNA damage sites. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 716—720. PMID 17643121 DOI:10.1038/nsmb1279
• Kim H., Huang J., Chen J. (2007). CCDC98 is a BRCA1-BRCT domain-binding protein involved in the DNA damage response. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 710—715. PMID 17643122 DOI:10.1038/nsmb1277
• Wang B., Elledge S.J. (2007). Ubc13/Rnf8 ubiquitin ligases control foci formation of the Rap80/Abraxas/Brca1/Brcc36 complex in response to DNA damage. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 20759—20763. PMID 18077395 DOI:10.1073/pnas.0710061104

Див. також

• Хромосома 5