UTP15

UTP15
Ідентифікатори
Символи	UTP15, NET21, small subunit processome component, UTP15 small subunit processome component
Зовнішні ІД	OMIM: 616194 MGI: 2145443 HomoloGene: 6629 GeneCards: UTP15
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • fibrillar center • ядерце • нуклеоплазма • клітинне ядро • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • rRNA processing • positive regulation of transcription by RNA polymerase I • positive regulation of rRNA processing • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ribosome biogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84135	105372
Ensembl	ENSG00000164338	ENSMUSG00000041747
UniProt	Q8TED0	Q8C7V3
RefSeq (мРНК)	NM_001284430 NM_001284431 NM_032175	NM_178918
RefSeq (білок)	NP_001271359 NP_001271360 NP_115551	NP_849249
Локус (UCSC)	Хр. 5: 73.57 – 73.58 Mb	Хр. 13: 98.38 – 98.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UTP15 (англ. UTP15, small subunit processome component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 518 амінокислот, а молекулярна маса — 58 415.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGYKPVAIQ		TYPILGEKIT		QDTLYWNNYK		TPVQIKEFGA		VSKVDFSPQP
PYNYAVTASS		RIHIYGRYSQ		EPIKTFSRFK		DTAYCATFRQ		DGRLLVAGSE
DGGVQLFDIS		GRAPLRQFEG		HTKAVHTVDF		TADKYHVVSG		ADDYTVKLWD
IPNSKEILTF		KEHSDYVRCG		CASKLNPDLF		ITGSYDHTVK		MFDARTSESV
LSVEHGQPVE		SVLLFPSGGL		LVSAGGRYVK		VWDMLKGGQL		LVSLKNHHKT
VTCLCLSSSG		QRLLSGSLDR		KVKVYSTTSY		KVVHSFDYAA		SILSLALAHE
DETIVVGMTN		GILSVKHRKS		EAKKESLPRR		RRPAYRTFIK		GKNYMKQRDD
ILINRPAKKH		LELYDRDLKH		FRISKALDRV		LDPTCTIKTP		EITVSIIKEL
NRRGVLANAL		AGRDEKEISH		VLNFLIRNLS		QPRFAPVLIN		AAEIIIDIYL
PVIGQSPVVD		KKFLLLQGLV		EKEIDYQREL		LETLGMMDML		FATMRRKEGT
SVLEHTSDGF		PENKKIES

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, процесінг рРНК, біогенез рибосом, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Prieto J.L., McStay B. (2007). Recruitment of factors linking transcription and processing of pre-rRNA to NOR chromatin is UBF-dependent and occurs independent of transcription in human cells. Genes Dev. 21: 2041—2054. PMID 17699751 DOI:10.1101/gad.436707
• Freed E.F., Prieto J.L., McCann K.L., McStay B., Baserga S.J. (2012). NOL11, implicated in the pathogenesis of North American Indian childhood cirrhosis, is required for pre-rRNA transcription and processing. PLoS Genet. 8: E1002892—E1002892. PMID 22916032 DOI:10.1371/journal.pgen.1002892

Див. також

• Хромосома 5