VAMP7

VAMP7
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DMW
Ідентифікатори
Символи	VAMP7, SYBL1, TI-VAMP, TIVAMP, VAMP-7, vesicle associated membrane protein 7
Зовнішні ІД	OMIM: 300053 MGI: 1096399 HomoloGene: 4121 GeneCards: VAMP7
Онтологія гена
Молекулярна функція	• SNARE binding; • SNAP receptor activity; • syntaxin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• екзосома; • transport vesicle; • Псевдоподія; • цитоплазма; • transport vesicle membrane; • синапс; • integral component of membrane; • trans-Golgi network; • azurophil granule membrane; • комплекс Ґольджі; • міжклітинні контакти; • platelet alpha granule; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • lamellipodium; • apical part of cell; • neuron projection; • мембрана; • cell surface; • phagocytic vesicle membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • perinuclear region of cytoplasm; • endoplasmic reticulum membrane; • secretory granule; • secretory granule membrane; • лізосома; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • late endosome membrane; • ендосома; • phagocytic vesicle; • клітинна мембрана; • lysosomal membrane; • SNARE complex; • clathrin-coated vesicle membrane; • Синаптичні бульбашки; • integral component of synaptic vesicle membrane; • hippocampal mossy fiber to CA3 synapse;
Біологічний процес	• GO:0000046 autophagosome maturation; • vesicle transport along microtubule; • vesicle fusion with Golgi apparatus; • Golgi to plasma membrane protein transport; • positive regulation of histamine secretion by mast cell; • SNARE complex assembly; • calcium-ion regulated exocytosis; • triglyceride transport; • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; • post-Golgi vesicle-mediated transport; • regulation of protein targeting to vacuolar membrane; • екзоцитоз; • natural killer cell degranulation; • phagocytosis, engulfment; • protein transport; • endosome to lysosome transport; • positive regulation of dendrite morphogenesis; • vesicle fusion; • vesicle-mediated transport; • neutrophil degranulation; • eosinophil degranulation; • ендоцитоз; • membrane organization; • GO:0015915 транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6845
	20955
	ENSG00000124333
	ENSMUSG00000051412
	P51809
	P70280
	NM_001145149; NM_001185183; NM_005638
	NM_001302138; NM_011515; NM_001359151
	NP_001138621; NP_001172112; NP_005629
	NP_001289067; NP_035645; NP_001346080
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

VAMP7 (англ. Vesicle associated membrane protein 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 220 амінокислот, а молекулярна маса — 24 935^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAILFAVVAR	GTTILAKHAW	CGGNFLEVTE	QILAKIPSEN	NKLTYSHGNY
LFHYICQDRI	VYLCITDDDF	ERSRAFNFLN	EIKKRFQTTY	GSRAQTALPY
AMNSEFSSVL	AAQLKHHSEN	KGLDKVMETQ	AQVDELKGIM	VRNIDLVAQR
GERLELLIDK	TENLVDSSVT	FKTTSRNLAR	AMCMKNLKLT	IIIIIVSIVF
IYIIVSPLCG	GFTWPSCVKK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, екзоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, апараті гольджі, синапсах, синаптосомах^[en], ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ward D.M., Pevsner J., Scullion M.A., Vaughn M., Kaplan J. (2000). Syntaxin 7 and VAMP-7 are soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptors required for late endosome-lysosome and homotypic lysosome fusion in alveolar macrophages. Mol. Biol. Cell. 11: 2327—2333. PMID 10888671 DOI:10.1091/mbc.11.7.2327

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11486 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.
↑ UniProt, P51809 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

Див. також

Хромосома X

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11486 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P51809 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

VAMP7

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук