VIRMA

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
VIRMA
Ідентифікатори
Символи VIRMA, fSAP121, MSTP054, KIAA1429, vir like m6A methyltransferase associated
Зовнішні ІД OMIM: 616447 MGI: 1913435 HomoloGene: 41043 GeneCards: VIRMA
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_183009
NM_015496
NM_001081183
NM_001347055
RefSeq (білок)
NP_056311
NP_892121
NP_001074652
NP_001333984
Локус (UCSC) Хр. 8: 94.49 – 94.55 Mb Хр. 4: 11.49 – 11.55 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

VIRMA (англ. Vir like m6A methyltransferase associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 812 амінокислот, а молекулярна маса — 202 025[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAVDSAMELLFLDTFKHPSAEQSSHIDVVRFPCVVYINEVRVIPPGVRAH
SSLPDNRAYGETSPHTFQLDLFFNNVSKPSAPVFDRLGSLEYDENTSIIF
RPNSKVNTDGLVLRGWYNCLTLAIYGSVDRVISHDRDSPPPPPPPPPPPQ
PQPSLKRNPKHADGEKEDQFNGSPPRPQPRGPRTPPGPPPPDDDEDDPVP
LPVSGDKEEDAPHREDYFEPISPDRNSVPQEGQYSDEGEVEEEQQEEGEE
DEDDVDVEEEEDEDEDDRRTVDSIPEEEEEDEEEEGEEDEEGEGDDGYEQ
ISSDEDGIADLERETFKYPNFDVEYTAEDLASVPPMTYDPYDRELVPLLY
FSCPYKTTFEIEISRMKDQGPDKENSGAIEASVKLTELLDLYREDRGAKW
VTALEEIPSLIIKGLSYLQLKNTKQDSLGQLVDWTMQALNLQVALRQPIA
LNVRQLKAGTKLVSSLAECGAQGVTGLLQAGVISGLFELLFADHVSSSLK
LNAFKALDSVISMTEGMEAFLRGRQNEKSGYQKLLELILLDQTVRVVTAG
SAILQKCHFYEVLSEIKRLGDHLAEKTSSLPNHSEPDHDTDAGLERTNPE
YENEVEASMDMDLLESSNISEGEIERLINLLEEVFHLMETAPHTMIQQPV
KSFPTMARITGPPERDDPYPVLFRYLHSHHFLELVTLLLSIPVTSAHPGV
LQATKDVLKFLAQSQKGLLFFMSEYEATNLLIRALCHFYDQDEEEGLQSD
GVIDDAFALWLQDSTQTLQCITELFSHFQRCTASEETDHSDLLGTLHNLY
LITFNPVGRSAVGHVFSLEKNLQSLITLMEYYSKEALGDSKSKKSVAYNY
ACILILVVVQSSSDVQMLEQHAASLLKLCKADENNAKLQELGKWLEPLKN
LRFEINCIPNLIEYVKQNIDNLMTPEGVGLTTALRVLCNVACPPPPVEGQ
QKDLKWNLAVIQLFSAEGMDTFIRVLQKLNSILTQPWRLHVNMGTTLHRV
TTISMARCTLTLLKTMLTELLRGGSFEFKDMRVPSALVTLHMLLCSIPLS
GRLDSDEQKIQNDIIDILLTFTQGVNEKLTISEETLANNTWSLMLKEVLS
SILKVPEGFFSGLILLSELLPLPLPMQTTQVIEPHDISVALNTRKLWSMH
LHVQAKLLQEIVRSFSGTTCQPIQHMLRRICVQLCDLASPTALLIMRTVL
DLIVEDLQSTSEDKEKQYTSQTTRLLALLDALASHKACKLAILHLINGTI
KGDERYAEIFQDLLALVRSPGDSVIRQQCVEYVTSILQSLCDQDIALILP
SSSEGSISELEQLSNSLPNKELMTSICDCLLATLANSESSYNCLLTCVRT
MMFLAEHDYGLFHLKSSLRKNSSALHSLLKRVVSTFSKDTGELASSFLEF
MRQILNSDTIGCCGDDNGLMEVEGAHTSRTMSINAAELKQLLQSKEESPE
NLFLELEKLVLEHSKDDDNLDSLLDSVVGLKQMLESSGDPLPLSDQDVEP
VLSAPESLQNLFNNRTAYVLADVMDDQLKSMWFTPFQAEEIDTDLDLVKV
DLIELSEKCCSDFDLHSELERSFLSEPSSPGRTKTTKGFKLGKHKHETFI
TSSGKSEYIEPAKRAHVVPPPRGRGRGGFGQGIRPHDIFRQRKQNTSRPP
SMHVDDFVAAESKEVVPQDGIPPPKRPLKVSQKISSRGGFSGNRGGRGAF
HSQNRFFTPPASKGNYSRREGTRGSSWSAQNTPRGNYNESRGGQSNFNRG
PLPPLRPLSSTGYRPSPRDRASRGRGGLGPSWASANSGSGGSRGKFVSGG
SGRGRHVRSFTR

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, метилювання. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
  • Niessen M., Schneiter R., Nothiger R. (2001). Molecular identification of virilizer, a gene required for the expression of the sex-determining gene Sex-lethal in Drosophila melanogaster. Genetics. 157: 679—688. PMID 11156988

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24500 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
  4. UniProt, Q69YN4 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]