Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
VIRMA (англ. Vir like m6A methyltransferase associated ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 812 амінокислот , а молекулярна маса — 202 025[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAVDSAMELL FLDTFKHPSA EQSSHIDVVR FPCVVYINEV RVIPPGVRAH
SSLPDNRAYG ETSPHTFQLD LFFNNVSKPS APVFDRLGSL EYDENTSIIF
RPNSKVNTDG LVLRGWYNCL TLAIYGSVDR VISHDRDSPP PPPPPPPPPQ
PQPSLKRNPK HADGEKEDQF NGSPPRPQPR GPRTPPGPPP PDDDEDDPVP
LPVSGDKEED APHREDYFEP ISPDRNSVPQ EGQYSDEGEV EEEQQEEGEE
DEDDVDVEEE EDEDEDDRRT VDSIPEEEEE DEEEEGEEDE EGEGDDGYEQ
ISSDEDGIAD LERETFKYPN FDVEYTAEDL ASVPPMTYDP YDRELVPLLY
FSCPYKTTFE IEISRMKDQG PDKENSGAIE ASVKLTELLD LYREDRGAKW
VTALEEIPSL IIKGLSYLQL KNTKQDSLGQ LVDWTMQALN LQVALRQPIA
LNVRQLKAGT KLVSSLAECG AQGVTGLLQA GVISGLFELL FADHVSSSLK
LNAFKALDSV ISMTEGMEAF LRGRQNEKSG YQKLLELILL DQTVRVVTAG
SAILQKCHFY EVLSEIKRLG DHLAEKTSSL PNHSEPDHDT DAGLERTNPE
YENEVEASMD MDLLESSNIS EGEIERLINL LEEVFHLMET APHTMIQQPV
KSFPTMARIT GPPERDDPYP VLFRYLHSHH FLELVTLLLS IPVTSAHPGV
LQATKDVLKF LAQSQKGLLF FMSEYEATNL LIRALCHFYD QDEEEGLQSD
GVIDDAFALW LQDSTQTLQC ITELFSHFQR CTASEETDHS DLLGTLHNLY
LITFNPVGRS AVGHVFSLEK NLQSLITLME YYSKEALGDS KSKKSVAYNY
ACILILVVVQ SSSDVQMLEQ HAASLLKLCK ADENNAKLQE LGKWLEPLKN
LRFEINCIPN LIEYVKQNID NLMTPEGVGL TTALRVLCNV ACPPPPVEGQ
QKDLKWNLAV IQLFSAEGMD TFIRVLQKLN SILTQPWRLH VNMGTTLHRV
TTISMARCTL TLLKTMLTEL LRGGSFEFKD MRVPSALVTL HMLLCSIPLS
GRLDSDEQKI QNDIIDILLT FTQGVNEKLT ISEETLANNT WSLMLKEVLS
SILKVPEGFF SGLILLSELL PLPLPMQTTQ VIEPHDISVA LNTRKLWSMH
LHVQAKLLQE IVRSFSGTTC QPIQHMLRRI CVQLCDLASP TALLIMRTVL
DLIVEDLQST SEDKEKQYTS QTTRLLALLD ALASHKACKL AILHLINGTI
KGDERYAEIF QDLLALVRSP GDSVIRQQCV EYVTSILQSL CDQDIALILP
SSSEGSISEL EQLSNSLPNK ELMTSICDCL LATLANSESS YNCLLTCVRT
MMFLAEHDYG LFHLKSSLRK NSSALHSLLK RVVSTFSKDT GELASSFLEF
MRQILNSDTI GCCGDDNGLM EVEGAHTSRT MSINAAELKQ LLQSKEESPE
NLFLELEKLV LEHSKDDDNL DSLLDSVVGL KQMLESSGDP LPLSDQDVEP
VLSAPESLQN LFNNRTAYVL ADVMDDQLKS MWFTPFQAEE IDTDLDLVKV
DLIELSEKCC SDFDLHSELE RSFLSEPSSP GRTKTTKGFK LGKHKHETFI
TSSGKSEYIE PAKRAHVVPP PRGRGRGGFG QGIRPHDIFR QRKQNTSRPP
SMHVDDFVAA ESKEVVPQDG IPPPKRPLKV SQKISSRGGF SGNRGGRGAF
HSQNRFFTPP ASKGNYSRRE GTRGSSWSAQ NTPRGNYNES RGGQSNFNRG
PLPPLRPLSS TGYRPSPRDR ASRGRGGLGP SWASANSGSG GSRGKFVSGG
SGRGRHVRSF TR
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК , сплайсинг мРНК , ацетилювання , альтернативний сплайсинг , метилювання .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res . 7 : 65—73. PMID 10718198 DOI :10.1093/dnares/7.1.65
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization . Nat. Biotechnol . 24 : 1285—1292. PMID 16964243 DOI :10.1038/nbt1240
Niessen M., Schneiter R., Nothiger R. (2001). Molecular identification of virilizer, a gene required for the expression of the sex-determining gene Sex-lethal in Drosophila melanogaster . Genetics . 157 : 679—688. PMID 11156988