VOPP1

VOPP1
Ідентифікатори
Символи	VOPP1, ECOP, GASP, vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, WBP1L2, WBP1/VOPP1 family member, VOPP1 WW domain binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 611915 MGI: 2141658 HomoloGene: 12772 GeneCards: VOPP1
Онтологія гена Молекулярна функція • signal transducer activity Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of organelle membrane • ендосома • cytoplasmic vesicle membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81552	232023
Ensembl	ENSG00000154978	ENSMUSG00000037788
UniProt	Q96AW1	Q8R1C3
RefSeq (мРНК)	NM_001284282 NM_001284283 NM_001284284 NM_030796 NM_001321242 NM_001321243 NM_001321244 NM_001321246 NM_001321247 NM_001321248 NM_001321249 NM_001321250 NM_001321251	NM_146168
RefSeq (білок)	NP_001271211 NP_001271212 NP_001271213 NP_001308171 NP_001308172 NP_001308173 NP_001308175 NP_001308176 NP_001308177 NP_001308178 NP_001308179 NP_001308180 NP_110423	NP_666280
Локус (UCSC)	Хр. 7: 55.44 – 55.57 Mb	Хр. 6: 57.7 – 57.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VOPP1 (англ. Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 172 амінокислот, а молекулярна маса — 19 224.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRRQPAKVAA		LLLGLLLECT		EAKKHCWYFE		GLYPTYYICR		SYEDCCGSRC
CVRALSIQRL		WYFWFLLMMG		VLFCCGAGFF		IRRRMYPPPL		IEEPAFNVSY
TRQPPNPGPG		AQQPGPPYYT		DPGGPGMNPV		GNSMAMAFQV		PPNSPQGSVA
CPPPPAYCNT		PPPPYEQVVK		AK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Park S., James C.D. (2005). ECop (EGFR-coamplified and overexpressed protein), a novel protein, regulates NF-kappaB transcriptional activity and associated apoptotic response in an IkappaBalpha-dependent manner. Oncogene. 24: 2495—2502. PMID 15735698 DOI:10.1038/sj.onc.1208496
• Baras A., Moskaluk C.A. (2010). Intracellular localization of GASP/ECOP/VOPP1. J. Mol. Histol. 41: 153—164. PMID 20571887 DOI:10.1007/s10735-010-9272-8

Див. також

• Хромосома 7