VPS36

VPS36
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2HTH, 2ZME, 3CUQ
Ідентифікатори
Символи	VPS36, C13orf9, EAP45, CGI-145, vacuolar protein sorting 36 homolog
Зовнішні ІД	OMIM: 610903 MGI: 1917410 HomoloGene: 9374 GeneCards: VPS36
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • protein C-terminus binding • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipid binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • late endosome • мембрана • late endosome membrane • лізосома • екзосома • клітинне ядро • ендосома • ESCRT II complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • multivesicular body assembly • transcription, DNA-templated • endosomal transport • protein transport • protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • macroautophagy • GO:0015915 транспорт • endosome transport via multivesicular body sorting pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51028	70160
Ensembl	ENSG00000136100	ENSMUSG00000031479
UniProt	Q86VN1	Q91XD6
RefSeq (мРНК)	NM_016075 NM_001282168 NM_001282169	NM_027338 NM_001368379
RefSeq (білок)	NP_001269097 NP_001269098 NP_057159	NP_081614 NP_001355308
Локус (UCSC)	Хр. 13: 52.41 – 52.45 Mb	Хр. 8: 22.68 – 22.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VPS36 (англ. Vacuolar protein sorting 36 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 386 амінокислот, а молекулярна маса — 43 817.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDRFVWTSGL		LEINETLVIQ		QRGVRIYDGE		EKIKFDAGTL		LLSTHRLIWR
DQKNHECCMA		ILLSQIVFIE		EQAAGIGKSA		KIVVHLHPAP		PNKEPGPFQS
SKNSYIKLSF		KEHGQIEFYR		RLSEEMTQRR		WENMPVSQSL		QTNRGPQPGR
IRAVGIVGIE		RKLEEKRKET		DKNISEAFED		LSKLMIKAKE		MVELSKSIAN
KIKDKQGDIT		EDETIRFKSY		LLSMGIANPV		TRETYGSGTQ		YHMQLAKQLA
GILQVPLEER		GGIMSLTEVY		CLVNRARGME		LLSPEDLVNA		CKMLEALKLP
LRLRVFDSGV		MVIELQSHKE		EEMVASALET		VSEKGSLTSE		EFAKLVGMSV
LLAKERLLLA		EKMGHLCRDD		SVEGLRFYPN		LFMTQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендосомах.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
• Wang T., Hong W. (2006). RILP interacts with VPS22 and VPS36 of ESCRT-II and regulates their membrane recruitment. Biochem. Biophys. Res. Commun. 350: 413—423. PMID 17010938 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.09.064
• Maleroed L., Stuffers S., Brech A., Stenmark H. (2007). Vps22/EAP30 in ESCRT-II mediates endosomal sorting of growth factor and chemokine receptors destined for lysosomal degradation. Traffic. 8: 1617—1629. PMID 17714434 DOI:10.1111/j.1600-0854.2007.00630.x
• Im Y.J., Hurley J.H. (2008). Integrated structural model and membrane targeting mechanism of the human ESCRT-II complex. Dev. Cell. 14: 902—913. PMID 18539118 DOI:10.1016/j.devcel.2008.04.004

Див. також

• Хромосома 13