VPS72

VPS72
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5FUG
Ідентифікатори
Символи	VPS72, CFL1, Swc2, TCFL1, YL-1, YL1, vacuolar protein sorting 72 homolog
Зовнішні ІД	OMIM: 600607 MGI: 1202305 HomoloGene: 110905 GeneCards: VPS72
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0031493 histone binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • somatic stem cell population maintenance • transcription, DNA-templated • GO:0035042 histone exchange • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6944	21427
Ensembl	ENSG00000163159	ENSMUSG00000008958
UniProt	Q15906	Q62481
RefSeq (мРНК)	NM_005997 NM_001271087 NM_001271088	NM_009336
RefSeq (білок)	NP_001258016 NP_001258017 NP_005988	NP_033362
Локус (UCSC)	Хр. 1: 151.18 – 151.2 Mb	Хр. 3: 95.02 – 95.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VPS72 (англ. Vacuolar protein sorting 72 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 364 амінокислот, а молекулярна маса — 40 594.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLAGGRAPR		KTAGNRLSGL		LEAEEEDEFY		QTTYGGFTEE		SGDDEYQGDQ
SDTEDEVDSD		FDIDEGDEPS		SDGEAEEPRR		KRRVVTKAYK		EPLKSLRPRK
VNTPAGSSQK		AREEKALLPL		ELQDDGSDSR		KSMRQSTAEH		TRQTFLRVQE
RQGQSRRRKG		PHCERPLTQE		ELLREAKITE		ELNLRSLETY		ERLEADKKKQ
VHKKRKCPGP		IITYHSVTVP		LVGEPGPKEE		NVDIEGLDPA		PSVSALTPHA
GTGPVNPPAR		CSRTFITFSD		DATFEEWFPQ		GRPPKVPVRE		VCPVTHRPAL
YRDPVTDIPY		ATARAFKIIR		EAYKKYITAH		GLPPTASALG		PGPPPPEPLP
GSGPRALRQK		IVIK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Horikawa I., Tanaka H., Yuasa Y., Suzuki M., Oshimura M. (1995). Molecular cloning of a novel human cDNA on chromosome 1q21 and its mouse homolog encoding a nuclear protein with DNA-binding ability. Biochem. Biophys. Res. Commun. 208: 999—1007. PMID 7702631 DOI:10.1006/bbrc.1995.1433
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Doyon Y., Selleck W., Lane W.S., Tan S., Cote J. (2004). Structural and functional conservation of the NuA4 histone acetyltransferase complex from yeast to humans. Mol. Cell. Biol. 24: 1884—1896. PMID 14966270 DOI:10.1128/MCB.24.5.1884-1896.2004

Див. також

• Хромосома 1